Quy trình tách chiết ADN trong phương pháp PCR nhằm chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm thực hiện như thế nào?

Trong quá trình áp dụng phương pháp PCR để chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm thì ở bước tách chiết ADN cần sử dụng thì quá trình tách chiết đó được thực hiện như thế nào? Kít tách chiết dùng trong quy trình tách chiết ADN có thể sử dụng loại kit nào?

Có thể sử dụng loại kit tách chiết ADN nào trong phương pháp PCR để chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm?

Theo tiết 6.1.4 tiểu mục 6.1 Mục 6 Tiêu chuẩn quốc gia TCVN 8710-12:2019 về Bệnh thủy sản - Quy trình chẩn đoán - Phần 12:Bệnh vi bảo tử do Enterocytozoon hepatopenaei ở tôm quy định về tách chiết ADN như sau:

"6 Chẩn đoán trong phòng thí nghiệm
6.1 Phương pháp PCR (Polymerase Chain Reaction)
...
6.1.4 Tách chiết ADN
Sử dụng bộ kít tách chiết (3.2.3) thích hợp và an toàn theo hướng dẫn của nhà sản xuất.
VÍ DỤ: Sử dụng kit tách chiết ADN: DNeasy® Blood & Tissue Kit (250) (Qiagen, Cat No. 69506)[1]) (xem phụ lục B).
..."

Theo Tiêu chuẩn nêu trên thì kit tách chiết ADN sử dụng trong phương pháp PCR để chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm không được quy định cụ thể.

Người thực hiện chẩn đoán có thể sử dụng bất kì loại kit tách chiết ADN nào miễn thích hợp và an toàn theo hướng dẫn của nhà sản xuất.

Có thể sử dụng kít tách chiết ADN: DNeasy® Blood & Tissue Kit (250) (Qiagen, Cat No. 69506) theo Tiêu chuẩn vừa nêu để thực hiện quá trình tách chiết ADN với phương pháp PCR để chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm.

Quy trình tách chiết ADN trong phương pháp PCR nhằm chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm thực hiện như thế nào?

Quy trình tách chiết ADN trong phương pháp PCR nhằm chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm thực hiện như thế nào? (Hình từ Internet)

Quy trình tách chiết ADN trong phương pháp PCR nhằm chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm thực hiện như thế nào?

Theo Phục lục B Tiêu chuẩn quốc gia TCVN 8710-12:2019 về Bệnh thủy sản - Quy trình chẩn đoán - Phần 12:Bệnh vi bảo tử do Enterocytozoon hepatopenaei ở tôm quy định quy định về quy trình tách chiết ADN như sau:

"B1. Quy trình tách chiết ADN sử dụng kit tách chiết DNeasy® Blood & Tissue Kit (250)
Nhỏ 20 µl proteinase K vào ống ly tâm 1,5 ml.
- Chuyển 30 mg bệnh phẩm vào ống ly tâm đã có proteinase K.
- Thêm 200 µl dung dịch AL (Lysis buffer).
- Trộn kỹ huyễn dịch trong 15 s, sau đó ly tâm nhanh bằng máy ly tâm nhanh spindown (4.1.5).
- Ủ ấm ở 56 °C trong 10 min, sau đó ly tâm nhanh bằng máy ly tâm nhanh spindown (4.1.5).
- Thêm 200 µl etanol (từ 96 % đến 100 %) (3.1.1) vào ống ly tâm.
- Trộn kỹ huyễn dịch trong 15 s, sau đó ly tâm nhanh bằng máy ly tâm nhanh spindown (4.1.5).
- Hút 420 µl huyễn dịch trong ống ly tâm trên, chuyển sang cột ly tâm có ống thu ở dưới.
- Ly tâm bằng máy ly tâm (4.1.3) với gia tốc 6 000 g trong 1 min ở nhiệt độ phòng.
- Thêm 500 µl dung dịch AW1 (Wash buffer 1) vào cột ly tâm có ống thu ở dưới.
- Ly tâm bằng máy ly tâm (4.1.3) với gia tốc 6 000 g trong 1 min ở nhiệt độ phòng.
- Thay ống thu ở dưới cột ly tâm.
- Thêm 500 µl dung dịch AW2 (Wash buffer 2) vào cột ly tâm có ống thu ở dưới.
- Ly tâm bằng máy ly tâm (4.1.3) với gia tốc 20 000 g trong 3 min ở nhiệt độ phòng.
- Chuyển cột ly tâm sang ống ly tâm 1,5 ml.
- Nhỏ 200 µl dung dịch AE (Elution buffer) vào cột ly tâm và giữ ở nhiệt độ phòng 1 min.
- Ly tâm bằng máy ly tâm (4.1.3) với gia tốc 6 000 g trong 1 min.
- Chuyển ADN đã thu được sang ống 1,5 ml khác.
CHÚ Ý: Mẫu đối chứng âm và mẫu đối chứng dương đều được tách chiết ADN trong cùng thời điểm với mẫu cần phát hiện ký sinh trùng Enterocytozoon hepatopenaei gây bệnh trên tôm."

Theo đó, quy trình tách chiết ADN được thực hiện theo Tiêu chuẩn vừa nêu trê. Cần lưu ý là mẫu đối chứng âm và mẫu đối chứng dương đều được tách chiết ADN trong cùng thời điểm với mẫu cần phát hiện ký sinh trùng Enterocytozoon hepatopenaei gây bệnh trên tôm.

Tôm được xác định là dương tính với bệnh vi bào tử khi phương pháp PCR cho kết quả chẩn đoán như thế nào?

Theo tiết 6.1.5.3.3 tiểu mục 6.1 Mục 6 Tiêu chuẩn quốc gia TCVN 8710-12:2019 về Bệnh thủy sản - Quy trình chẩn đoán - Phần 12:Bệnh vi bảo tử do Enterocytozoon hepatopenaei ở tôm quy định về việc đọc kết quả chẩn đoáng bệnh vi bào tử bằng phương pháp PCR như sau:

"6 Chẩn đoán trong phòng thí nghiệm
6.1 Phương pháp PCR (Polymerase Chain Reaction)
...
6.1.5.3.3 Đọc kết quả
Sau khi điện di, đọc kết quả trên máy đọc gel (4.1.7).
Điều kiện phản ứng được công nhận khi:
- Mẫu đối chứng âm không có vạch sáng (không có sản phẩm khuếch đại);
- Mẫu đối chứng dương có vạch sáng kích thước 510 bp.
Với điều kiện phản ứng trên:
Kết quả mẫu thử dương tính khi:
- Tại giếng mẫu thử xuất hiện vạch sáng có kích thước 510 bp.
- Thang chuẩn ADN phân vạch rõ ràng.
Kết quả mẫu thử âm tính khi:
- Tại giếng mẫu thử không xuất hiện vạch sáng.
- Thang chuẩn ADN phân vạch rõ ràng"

Như vậy, mẫu kết quả sau khi thực hiện phương pháp PCR được xác định là dương tính khi:

- Tại giếng mẫu thử xuất hiện vạch sáng có kích thước 510 bp.

- Thang chuẩn ADN phân vạch rõ ràng.

Bên cạnh đó, người thực hiện chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm bằng phương pháp PCR cần lưu y rằng điều kiện phản ứng chỉ được công nhận khi:

- Mẫu đối chứng âm không có vạch sáng (không có sản phẩm khuếch đại);

- Mẫu đối chứng dương có vạch sáng kích thước 510 bp.

Bệnh vi bào tử ở tôm
Căn cứ pháp lý
MỚI NHẤT
Pháp luật
Mẫu thử sử dụng cho phương pháp kiểm tra bệnh vi bào tử bằng phương pháp nhuộm HE được quy định như thế nào?
Pháp luật
Cặp mồi trong phương pháp Realtime PCR để phát hiện vi bào tử trùng gây nên bệnh vi bào tử ở tôm có khác với cặp mồi dùng trong phương pháp PCR không?
Pháp luật
Quy trình tách chiết ADN trong phương pháp PCR nhằm chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm thực hiện như thế nào?
Pháp luật
Chu trình luân nhiệt trong phương pháp PCR nhằm chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm được thực hiện như thế nào?
Pháp luật
Dung dịch đệm TAE có được sử dụng trong phương pháp PCR để chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm khi có triệu chứng nhiễm bệnh hay không?
Pháp luật
Mẫu bệnh phẩm dùng để chẩn đoán bệnh vi bào tử ở tôm bằng phương pháp PCR phải được bảo quản ở nhiệt độ bao nhiêu thì thích hợp?
Pháp luật
Số lượng mẫu tôm có triệu chứng nhiễm bệnh vi bào tử cần lấy để tiến hành chẩn đoán bệnh bằng phương pháp PCR là bao nhiêu?
Pháp luật
Tôm thẻ chân trắng nhiễm bệnh vi bào tử sẽ có những triệu chứng lâm sàng như thế nào? Nguyên nhân tôm nhiễm bệnh là do đâu?
Đặt câu hỏi

Quý khách cần hỏi thêm thông tin về có thể đặt câu hỏi tại đây.

Đi đến trang Tìm kiếm nội dung Tư vấn pháp luật - Bệnh vi bào tử ở tôm
2,292 lượt xem
TÌM KIẾM LIÊN QUAN
Bệnh vi bào tử ở tôm
Chủ quản: Công ty THƯ VIỆN PHÁP LUẬT. Giấy phép số: 27/GP-TTĐT, do Sở TTTT TP. HCM cấp ngày 09/05/2019.
Chịu trách nhiệm chính: Ông Bùi Tường Vũ - Số điện thoại liên hệ: 028 3930 3279
Địa chỉ: P.702A , Centre Point, 106 Nguyễn Văn Trỗi, P.8, Q. Phú Nhuận, TP. HCM;
Địa điểm Kinh Doanh: Số 17 Nguyễn Gia Thiều, P. Võ Thị Sáu, Q3, TP. HCM;
Chứng nhận bản quyền tác giả số 416/2021/QTG ngày 18/01/2021, cấp bởi Bộ Văn hoá - Thể thao - Du lịch
Thông báo
Bạn không có thông báo nào
Type: