Cục Thuế hướng dẫn thuế TNCN tiền lương tiền công của cá nhân từ thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ có sử dụng NSNN theo Công văn 5680 ra sao?

Ngày 01/12/2025, Cục Thuế hướng dẫn thuế TNCN tiền lương tiền công của cá nhân từ thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ có sử dụng NSNN theo Công văn 5680 ra sao?

>>> Xem chi tiết Công văn 5680/CT-CS tại đây.

Ngày 01/12/2025, Cục Thuế ban hành Công văn 5680/CT-CS thuế TNCN tiền lương, tiền công gửi Ban Tuyên giáo và Dân vận Trung ương.

Theo đó, Cục Thuế nhận được công văn số 1879-CV/BTGVTW ngày 13/8/2025 của Ban Tuyên giáo và Dân vận Trung ương về việc đề nghị không tính vào thu nhập chịu thuế thu nhập cá nhân (TNCN) đối với các khoản thu nhập từ tiền lương tiền công của cá nhân từ thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ có sử dụng ngân sách nhà nước. Về vấn đề này, Cục Thuế có ý kiến như sau:

- Căn cứ Điều 11 Luật thuế thu nhập cá nhân 2007; điểm c, khoản 2 Điều 2 Thông tư 111/2013/TT-BTC; khoản 2 Điều 9 Nghị quyết 193/2025/QH15 (áp dụng từ ngày 19/02/2025 đến trước ngày 01/10/2025); Điều 11 Nghị định 88/2025/NĐ-CP (hiệu lực từ 13/4/2025); khoản 3 Điều 71 Luật Khoa học, Công nghệ và Đổi mới sáng tạo 2025 bổ sung vào Điều 4 (thu nhập miễn thuế) của Luật thuế thu nhập cá nhân 2007 (Luật KH, CN&ĐMST có hiệu lực từ ngày 01/10/2025); Điều 16 Luật Khoa học, Công nghệ và Đổi mới sáng tạo 2025; khoản 9 Điều 71 Luật khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo 2025;

- Liên quan đến nội dung này, Bộ Khoa học và công nghệ có công văn số 5460/BKHCN-KHTC ngày 09/10/2025 gửi Cục Thuế (công văn photo kèm theo).

Căn cứ các quy định và hướng dẫn nêu trên thì:

Trường hợp cá nhân nhận được các khoản thu nhập từ tiền lương, tiền công trước ngày 19/02/2025 từ thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ có sử dụng ngân sách nhà nước thì khoản thu nhập này tính vào thu nhập chịu thuề TNCN từ tiền lương, tiền công theo quy định tại Luật Thuế thu nhập cá nhân 2007 đã được sửa đổi, bổ sung năm 2012 và các văn bản hướng dẫn chi tiết Luật Thuế thu nhập cá nhân 2007, Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế thu nhập cá nhân.

Trường hợp cá nhân nhận được các khoản thu nhập từ tiền lương tiền công từ thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ có sử dụng ngân sách nhà nước từ ngày 19/02/2025 đến trước ngày 01/10/2025 thì thực hiện theo quy định tại khoản Điều 9 Nghị quyết 193/2025/QH15, khoản 2 Điều 11 Nghị định 88/2025/NĐ-CP ngày 13/4/2025 của Chính phủ.

Từ ngày 01/10/2025 đến nay, thu nhập từ tiền lương, tiền công từ thực hiện nhiệm vụ khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo thực hiện theo quy định tại khoản 3 Điều 71 Luật Khoa học, Công nghệ và Đổi mới sáng tạo 2025.

Hiện nay, Bộ Tài chính đang trình Quốc hội dự thảo Luật thuế TNCN (sửa đổi), dự kiến Quốc hội thông qua vào tháng 12/2025, trong đó có quy định thu nhập từ tiền lương, tiền công từ thực hiện nhiệm vụ khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo.

>>> Tính thuế TNCN từ 01/01/2026 - 30/06/2026 tại đây.

>>> Tính thuế TNCN theo biểu thuế mới từ 01/07/2026 tại đây.

Cục Thuế hướng dẫn thuế TNCN tiền lương tiền công của cá nhân từ thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ có sử dụng NSNN theo Công văn 5680 ra sao? (Hình từ Internet)

Thu nhập từ tiền lương, tiền công gồm những khoản nào?

Căn cứ theo khoản 2 Điều 3 Luật Thuế thu nhập cá nhân 2007 được sửa đổi bởi khoản 1 Điều 1 Luật Thuế thu nhập cá nhân sửa đổi 2012 quy định thu nhập từ tiền lương, tiền công gồm những khoản sau:

- Tiền lương, tiền công và các khoản có tính chất tiền lương, tiền công;

- Các khoản phụ cấp, trợ cấp, trừ các khoản: phụ cấp, trợ cấp theo quy định của pháp luật về ưu đãi người có công; phụ cấp quốc phòng, an ninh; phụ cấp độc hại, nguy hiểm đối với ngành, nghề hoặc công việc ở nơi làm việc có yếu tố độc hại, nguy hiểm; phụ cấp thu hút, phụ cấp khu vực theo quy định của pháp luật; trợ cấp khó khăn đột xuất, trợ cấp tai nạn lao động, bệnh nghề nghiệp, trợ cấp một lần khi sinh con hoặc nhận nuôi con nuôi, trợ cấp do suy giảm khả năng lao động, trợ cấp hưu trí một lần, tiền tuất hàng tháng và các khoản trợ cấp khác theo quy định của pháp luật về bảo hiểm xã hội; trợ cấp thôi việc, trợ cấp mất việc làm theo quy định của Bộ luật lao động; trợ cấp mang tính chất bảo trợ xã hội và các khoản phụ cấp, trợ cấp khác không mang tính chất tiền lương, tiền công theo quy định của Chính phủ.

Thời điểm xác định thu nhập chịu thuế TNCN từ tiền lương, tiền công là khi nào?

Căn cứ theo khoản 2 Điều 11 Nghị định 65/2013/NĐ-CP được sửa đổi bởi khoản 8 Điều 2 Nghị định 12/2015/NĐ-CP quy định như sau:

Thuế đối với thu nhập từ tiền lương, tiền công

1. Thu nhập chịu thuế từ tiền lương, tiền công được xác định theo quy định tại Khoản 2 Điều 3 Nghị định này.

2. Thời điểm xác định thu nhập chịu thuế từ tiền lương, tiền công là thời điểm người sử dụng lao động trả tiền lương, tiền công cho người nộp thuế hoặc thời điểm người nộp thuế nhận được thu nhập.

Trường hợp người sử dụng lao động mua cho người lao động bảo hiểm nhân thọ (trừ bảo hiểm hưu trí tự nguyện), bảo hiểm không bắt buộc khác có tích lũy về phí bảo hiểm của doanh nghiệp bảo hiểm được thành lập và hoạt động theo quy định của pháp luật Việt Nam, người lao động chưa phải tính vào thu nhập chịu thuế tại thời điểm mua bảo hiểm. Đến thời điểm đáo hạn hợp đồng, doanh nghiệp bảo hiểm có trách nhiệm khấu trừ tiền thuế theo tỷ lệ 10% trên khoản tiền phí tích lũy tương ứng với phần người sử dụng lao động mua cho người lao động từ ngày 01 tháng 7 năm 2013.

Trường hợp người sử dụng lao động mua cho người lao động bảo hiểm nhân thọ (trừ bảo hiểm hưu trí tự nguyện), bảo hiểm không bắt buộc khác có tích lũy về phí bảo hiểm của doanh nghiệp bảo hiểm không thành lập và hoạt động theo pháp luật Việt Nam được phép bán bảo hiểm tại Việt Nam thì người sử dụng lao động có trách nhiệm khấu trừ thuế theo tỷ lệ 10% trên khoản tiền phí bảo hiểm đã mua hoặc đóng góp trước khi trả thu nhập cho người lao động.

3. Xác định doanh thu tính thuế từ kinh doanh:

a) Doanh thu tính thuế đối với cá nhân kinh doanh là mức doanh thu khoán được ổn định trong 01 năm. Trường hợp qua số liệu điều tra xác minh, kiểm tra, thanh tra có căn cứ xác định doanh thu tính thuế thay đổi từ 50% trở lên so với mức doanh thu khoán, cơ quan thuế xác định lại mức doanh thu khoán theo quy định của pháp luật về quản lý thuế để áp dụng cho thời gian còn lại của năm tính thuế.

b) Doanh thu tính thuế đối với cá nhân kinh doanh được xác định theo quy định của pháp luật về quản lý thuế trên cơ sở số liệu điều tra, khảo sát, kết quả kiểm tra, thanh tra về cá nhân kinh doanh và các khoản mục chi phí thực tế để tạo ra doanh thu của cá nhân kinh doanh.

Bộ Tài chính xây dựng cơ sở dữ liệu quản lý rủi ro đối với cá nhân kinh doanh phù hợp với thực tiễn, đảm bảo yêu cầu quản lý.

...

Theo đó, thời điểm xác định thu nhập chịu thuế từ tiền lương, tiền công là thời điểm người sử dụng lao động trả tiền lương, tiền công cho người nộp thuế hoặc thời điểm người nộp thuế nhận được thu nhập.