Đóng cửa chi nhánh phụ thuộc khác tỉnh có phát sinh doanh thu, có xuất hóa đơn thì có phải quyết toán thuế GTGT, TNCN tại chi nhánh không?
Căn cứ vào Điều 66 Nghị định 168/2025/NĐ-CP có quy định như sau:
Đăng ký chấm dứt hoạt động chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh
1. Trước khi đăng ký chấm dứt hoạt động chi nhánh, văn phòng đại diện thì doanh nghiệp, chi nhánh, văn phòng đại diện phải thực hiện thủ tục với Cơ quan thuế để hoàn thành nghĩa vụ nộp thuế theo quy định của pháp luật về thuế.
2. Trong thời hạn 10 ngày kể từ ngày quyết định chấm dứt hoạt động chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh, doanh nghiệp gửi hồ sơ đăng ký chấm dứt hoạt động chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh đến Cơ quan đăng ký kinh doanh cấp tỉnh nơi đặt chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh.
...
Theo quy định trên, trước khi chi nhánh chấp dứt hoạt động thì phải hoàn thành nghĩa vụ nộp thuế theo quy định của pháp luật về thuế.
Dựa vào khoản 1 Điều 11 Nghị định 126/2020/NĐ-CP có quy định về địa điểm nộp hồ sơ khai thuế như sau:
Địa điểm nộp hồ sơ khai thuế
Người nộp thuế thực hiện các quy định về địa điểm nộp hồ sơ khai thuế theo quy định tại khoản 1, khoản 2 và khoản 3 Điều 45 Luật Quản lý thuế và các quy định sau đây:
1. Địa điểm nộp hồ sơ khai thuế đối với người nộp thuế có nhiều hoạt động, kinh doanh trên nhiều địa bàn cấp tỉnh theo quy định tại điểm a, điểm b khoản 4 Điều 45 Luật Quản lý thuế là cơ quan thuế nơi có hoạt động kinh doanh khác tỉnh, thành phố nơi có trụ sở chính đối với các trường hợp sau đây:
a) Khai thuế giá trị gia tăng của dự án đầu tư đối với trường hợp quy định tại điểm d khoản 2 Điều 7 Nghị định này tại nơi có dự án đầu tư.
b) Khai thuế giá trị gia tăng đối với hoạt động chuyển nhượng bất động sản của dự án đầu tư cơ sở hạ tầng, nhà để chuyển nhượng (bao gồm cả trường hợp có thu tiền ứng trước của khách hàng theo tiến độ) tại nơi có hoạt động chuyển nhượng bất động sản.
c) Khai thuế giá trị gia tăng tại nơi có nhà máy sản xuất điện.
d) Khai thuế tiêu thụ đặc biệt tại nơi sản xuất, gia công hàng hoá chịu thuế tiêu thụ đặc biệt hoặc nơi cung ứng dịch vụ chịu thuế tiêu thụ đặc biệt (trừ hoạt động kinh doanh xổ số điện toán).
...
Theo đó, địa điểm nộp hồ sơ khai thuế đối với người nộp thuế có nhiều hoạt động, kinh doanh trên nhiều địa bàn cấp tỉnh là cơ quan thuế nơi có hoạt động kinh doanh khác tỉnh, thành phố nơi có trụ sở chính.
Có thể hiểu là, đối với chi nhánh phụ thuộc hạch toán khác tỉnh có phát sinh doanh thu, có xuất hóa đơn thì phải khai thuế tại cơ quan thuế quản lý chi nhánh.
Cụ thể như sau:
Tại khoản 4 Điều 13 Thông tư 80/2021/TT-BTC có quy định về khai thuế, tính thuế, phân bổ và nộp thuế giá trị gia tăng như sau:
Khai thuế, tính thuế, phân bổ và nộp thuế giá trị gia tăng
...
4. Đối với đơn vị phụ thuộc trực tiếp bán hàng, sử dụng hoá đơn do đơn vị phụ thuộc đăng ký hoặc do người nộp thuế đăng ký với cơ quan thuế quản lý đơn vị phụ thuộc, theo dõi hạch toán đầy đủ thuế giá trị gia tăng đầu ra, đầu vào thì đơn vị phụ thuộc khai thuế, nộp thuế giá trị gia tăng cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp của đơn vị phụ thuộc.
...
Theo đó, đơn vị phụ thuộc đã kê khai nộp thuế GTGT cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp chi nhánh thì khi chấm dứt hoạt động kinh doanh phải hoàn thành nghĩa vụ thuế, trong đó có kê khai quyết toán thuế tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp chi nhánh.
Tại khoản 3 Điều 19 Thông tư 80/2021/TT-BTC có quy định về khai thuế, tính thuế, phân bổ thuế TNCN như sau:
Khai thuế, tính thuế, phân bổ thuế thu nhập cá nhân
...
3. Khai thuế, nộp thuế:
a) Thuế thu nhập cá nhân đối với thu nhập từ tiền lương, tiền công:
a.1) Người nộp thuế chi trả tiền lương, tiền công cho người lao động làm việc tại đơn vị phụ thuộc, địa điểm kinh doanh tại tỉnh khác với nơi có trụ sở chính, thực hiện khấu trừ thuế thu nhập cá nhân đối với thu nhập từ tiền lương, tiền công theo quy định và nộp hồ sơ khai thuế theo mẫu số 05/KK-TNCN, phụ lục bảng xác định số thuế thu nhập cá nhân phải nộp cho các địa phương được hưởng nguồn thu theo mẫu số 05-1/PBT-KK-TNCN ban hành kèm theo phụ lục II Thông tư này cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp; nộp số thuế thu nhập cá nhân đối với thu nhập từ tiền lương, tiền công vào ngân sách nhà nước cho từng tỉnh nơi người lao động làm việc theo quy định tại khoản 4 Điều 12 Thông tư này. Số thuế thu nhập cá nhân xác định cho từng tỉnh theo tháng hoặc quý tương ứng với kỳ khai thuế thu nhập cá nhân và không xác định lại khi quyết toán thuế thu nhập cá nhân.
...
Theo đó, nếu trụ sở chính là người thực hiện chi trả tiền lương cho người lao động làm việc tại chi nhánh phụ thuộc thì phải nộp hồ sơ khai thuế TNCN tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp trụ sở.
Khi đó, người nộp thuế xác định riêng số thuế thu nhập cá nhân phải phân bổ đối với thu nhập từ tiền lương, tiền công của cá nhân làm việc tại từng tỉnh theo số thuế thực tế đã khấu trừ của từng cá nhân.
Trong trường hợp này, nếu chi nhánh phụ thuộc khác tỉnh chấm dứt hoạt động thì chi nhánh không phải quyết toán thuế TNCN mà chính trụ sở sẽ là nơi quyết toán thuế TNCN.

Đóng cửa chi nhánh phụ thuộc khác tỉnh có phát sinh doanh thu, có xuất hóa đơn thì có phải quyết toán thuế GTGT, TNCN tại chi nhánh không? (Hình từ Internet)
Chi nhánh của công ty ở khác tỉnh là nơi kho hàng và giao hàng thì có được phân bổ thuế GTGT không?
Căn cứ vào Điều 13 Thông tư 80/2021/TT-BTC có quy định về phân bổ thuế GTGT như sau:
Khai thuế, tính thuế, phân bổ và nộp thuế giá trị gia tăng
1. Các trường hợp được phân bổ:
a) Hoạt động kinh doanh xổ số điện toán;
b) Hoạt động chuyển nhượng bất động sản, trừ trường hợp quy định tại điểm b khoản 1 Điều 11 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP;
c) Hoạt động xây dựng theo quy định của pháp luật về hệ thống ngành kinh tế quốc dân và quy định của pháp luật chuyên ngành;
d) Đơn vị phụ thuộc, địa điểm kinh doanh là cơ sở sản xuất (bao gồm cả cơ sở gia công, lắp ráp), trừ trường hợp quy định tại điểm c khoản 1 Điều 11 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP;
đ) Nhà máy thủy điện nằm trên nhiều tỉnh.
...
Theo quy định trên, đơn vị phụ thuộc, địa điểm kinh doanh là cơ sở sản xuất thì sẽ được phân bổ thuế GTGT đầu vào, trừ quy định tại điểm c khoản 1 Điều 11 Nghị định 126/2020/NĐ-CP.
Vì vậy, Chi nhánh của công ty ở khác tỉnh là nơi kho hàng và giao hàng thì sẽ không được phân bổ thuế GTGT vì không là cơ sở sản xuất.
Chi nhánh doanh nghiệp có thể có các tình trạng pháp lý nào?
Căn cứ theo quy định tại Điều 36 Nghị định 168/2025/NĐ-CP quy định về tình trạng pháp lý của chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh thì chi nhánh doanh nghiệp có thể có các tình trạng pháp lý sau:
(1) “Đang hoạt động” là tình trạng pháp lý của chi nhánh doanh nghiệp đã được cấp Giấy chứng nhận đăng ký hoạt động chi nhánh doanh nghiệp Giấy chứng nhận đăng ký địa điểm kinh doanh mà không thuộc tình trạng pháp lý quy định tại các khoản 2, 3, 4, 5 và 6 Điều 36 Nghị định 168/2025/NĐ-CP
(2) “Tạm ngừng kinh doanh, hoạt động” là tình trạng pháp lý của chi nhánh doanh nghiệp đang trong thời gian tạm ngừng kinh doanh.
(3) “Không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký” là tình trạng pháp lý của chi nhánh doanh nghiệp được Cơ quan thuế lập biên bản xác minh về việc không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký. Thông tin về chi nhánh doanh nghiệp không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký do Cơ quan thuế cung cấp cho Cơ quan đăng ký kinh doanh cấp tỉnh. Việc chuyển tình trạng pháp lý và kết thúc tình trạng pháp lý này do Cơ quan thuế quyết định, trừ trường hợp chi nhánh doanh nghiệp đang thuộc tình trạng pháp lý quy định tại các khoản 2, 4, 5 và 6 Điều 36 Nghị định 168/2025/NĐ-CP. Cơ quan thuế có trách nhiệm gửi thông tin về tình trạng pháp lý “Không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký” của chi nhánh doanh nghiệp cho Cơ quan đăng ký kinh doanh cấp tỉnh. Cơ quan đăng ký kinh doanh cấp tỉnh ghi nhận, cập nhật tình trạng pháp lý do Cơ quan thuế cung cấp vào Cơ sở dữ liệu quốc gia về đăng ký doanh nghiệp.
(4) “Bị thu hồi do cưỡng chế về quản lý thuế” là tình trạng pháp lý của chi nhánh doanh nghiệp đã bị ra quyết định thu hồi Giấy chứng nhận đăng ký hoạt động chi nhánh doanh nghiệp hoặc chi nhánh doanh nghiệp bị ra quyết định thu hồi Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp theo đề nghị của Cơ quan quản lý thuế về thực hiện biện pháp cưỡng chế thi hành quyết định hành chính về quản lý thuế.
(5) “Đang làm thủ tục chấm dứt hoạt động” là tình trạng pháp lý của chi nhánh doanh nghiệp đã được Cơ quan đăng ký kinh doanh cấp tỉnh ra thông báo đang làm thủ tục chấm dứt hoạt động hoặc chi nhánh doanh nghiệp của doanh nghiệp đang làm thủ tục phá sản.
(6) “Đã chấm dứt hoạt động” là tình trạng pháp lý của chi nhánh doanh nghiệp đã được Cơ quan đăng ký kinh doanh cấp tỉnh ra thông báo về việc chấm dứt hoạt động chi nhánh doanh nghiệp hoặc chi nhánh doanh nghiệp của doanh nghiệp đã phá sản.
Bài viết này có hữu ích không?
- - Nội dung nêu trên là phần giải đáp, tư vấn của chúng tôi dành cho khách hàng của THƯ VIỆN PHÁP LUẬT. Nếu quý khách còn vướng mắc, vui lòng gửi về Email [email protected];
- - Nội dung bài viết chỉ mang tính chất tham khảo;
- - Điều khoản được áp dụng có thể đã hết hiệu lực tại thời điểm bạn đang đọc;
- - Mọi ý kiến thắc mắc về bản quyền của bài viết vui lòng liên hệ qua địa chỉ mail [email protected];