Doanh nghiệp kho bãi có được miễn lập hồ sơ giao dịch liên kết hay không?

Doanh nghiệp kho bãi có được miễn lập hồ sơ giao dịch liên kết hay không?

Căn cứ điểm c khoản 2 Điều 20 Nghị định 255/2026/NĐ-CP quy định các trường hợp người nộp thuế được miễn kê khai, miễn lập Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết như sau:

Các trường hợp người nộp thuế được miễn kê khai, miễn lập Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết

...

2. Người nộp thuế có trách nhiệm kê khai xác định giá giao dịch liên kết theo Phụ lục I ban hành kèm theo Nghị định này nhưng được miễn lập Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết trong các trường hợp sau:

...

c) Người nộp thuế thực hiện kinh doanh không phát sinh doanh thu, chi phí từ hoạt động khai thác, sử dụng tài sản vô hình, có doanh thu dưới 500 tỷ đồng, áp dụng tỷ suất lợi nhuận thuần chưa trừ chi phí lãi vay và thuế thu nhập doanh nghiệp (không bao gồm chênh lệch doanh thu và chi phí của hoạt động tài chính) trên doanh thu thuần, bao gồm các lĩnh vực như sau:

c.1) Phân phối: Từ 5% trở lên;

c.2) Sản xuất: Từ 10% trở lên;

c.3) Gia công: Từ 15% trở lên.

Trường hợp người nộp thuế theo dõi, hạch toán riêng doanh thu, chi phí của từng lĩnh vực thì áp dụng tỷ suất lợi nhuận thuần chưa trừ chi phí lãi vay và thuế thu nhập doanh nghiệp trên doanh thu thuần tương ứng với từng lĩnh vực.

Trường hợp người nộp thuế theo dõi, hạch toán riêng được doanh thu nhưng không theo dõi, hạch toán riêng được chi phí phát sinh của từng lĩnh vực trong hoạt động sản xuất, kinh doanh thì thực hiện phân bổ chi phí theo tỷ lệ doanh thu của từng lĩnh vực để áp dụng tỷ suất lợi nhuận thuần chưa trừ chi phí lãi vay và thuế thu nhập doanh nghiệp trên doanh thu thuần tương ứng với từng lĩnh vực.

Trường hợp người nộp thuế không theo dõi, hạch toán riêng được doanh thu và chi phí của từng lĩnh vực hoạt động sản xuất, kinh doanh để xác định tỷ suất lợi nhuận thuần chưa trừ chi phí lãi vay và thuế thu nhập doanh nghiệp tương ứng với từng lĩnh vực thì áp dụng tỷ suất lợi nhuận thuần chưa trừ chi phí lãi vay và thuế thu nhập doanh nghiệp trên doanh thu thuần của lĩnh vực có tỷ suất cao nhất.

Trường hợp người nộp thuế không áp dụng theo mức tỷ suất lợi nhuận thuần quy định tại điểm này thì phải lập Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết theo quy định.

...

Tham khảo tại Công văn 13913/TPHCM-QLDN3 năm 2026 Tải về Thuế TP Hồ Chí Minh có hướng dẫn việc xác định lĩnh vực áp dụng theo điểm c khoản 2 Điều 20 Nghị định 255/2026/NĐ-CP, cụ thể:

Như vậy, doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực kho bãi và lưu giữ hàng hóa không thuộc trường hợp được miễn lập Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết, nếu hoạt động này không thuộc các lĩnh vực phân phối, sản xuất hoặc gia công được quy định tại điểm c khoản 2 Điều 20 Nghị định 255/2026/NĐ-CP.

Doanh nghiệp kho bãi có được miễn lập hồ sơ giao dịch liên kết hay không? (Hình từ Internet)

Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết lập khi nào theo Nghị định 255?

Căn cứ tại khoản 3 Điều 18 Nghị định 255/2026/NĐ-CP quy định nghĩa vụ của người nộp thuế trong kê khai, lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết như sau:

Quyền và nghĩa vụ của người nộp thuế trong kê khai, lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết

...

3. Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết được lập trước thời điểm kê khai quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp hằng năm và phải lưu giữ, xuất trình theo yêu cầu cung cấp thông tin của cơ quan thuế.

Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết và các thông tin tài liệu, chứng từ của người nộp thuế cung cấp cho cơ quan thuế thực hiện theo quy định của pháp luật quản lý thuế. Các dữ liệu, chứng từ và tài liệu sử dụng làm căn cứ phân tích, so sánh, xác định giá giao dịch liên kết phải nêu rõ nguồn gốc xuất xứ. Trường hợp dữ liệu của các đối tượng so sánh độc lập là số liệu kế toán, người nộp thuế có trách nhiệm lưu trữ và cung cấp cho cơ quan thuế bằng bản mềm, dưới định dạng bảng tính.

...

Theo đó, hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết được lập trước thời điểm kê khai quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp hằng năm và phải lưu giữ, xuất trình theo yêu cầu cung cấp thông tin của cơ quan thuế.

Hiện nay, cơ quan thuế áp dụng quản lý rủi ro khi kiểm tra doanh nghiệp có giao dịch liên kết ra sao?

Căn cứ Điều 21 Nghị định 255/2026/NĐ-CP quy định quản lý rủi ro đối với giá giao dịch liên kết như sau:

Trách nhiệm và quyền hạn của cơ quan thuế trong quản lý giá giao dịch liên kết

1. Áp dụng quản lý rủi ro trong quản lý thuế đối với giá giao dịch liên kết theo quy định của pháp luật thuế.

a) Quản lý, sử dụng thông tin của người nộp thuế có giao dịch liên kết phục vụ công tác quản lý rủi ro;

b) Áp dụng quản lý rủi ro trong việc lập kế hoạch kiểm tra doanh nghiệp có quan hệ liên kết và giao dịch liên kết;

c) Quản lý, sử dụng Báo cáo lợi nhuận liên quốc gia của người nộp thuế phục vụ công tác quản lý rủi ro, trao đổi thông tin theo quy định và cam kết của Việt Nam tại Thỏa thuận quốc tế về thuế, không sử dụng để điều chỉnh hoặc ấn định giá giao dịch liên kết.

...

Như vậy, cơ quan thuế được quản lý, sử dụng thông tin của người nộp thuế có giao dịch liên kết để phục vụ công tác quản lý rủi ro, áp dụng quản lý rủi ro trong việc lập kế hoạch kiểm tra đối với doanh nghiệp có quan hệ liên kết và giao dịch liên kết.

Đồng thời, cơ quan thuế được quản lý, sử dụng Báo cáo lợi nhuận liên quốc gia của người nộp thuế để phục vụ quản lý rủi ro và trao đổi thông tin theo quy định, cam kết của Việt Nam tại các Thỏa thuận quốc tế về thuế. Tuy nhiên, Báo cáo lợi nhuận liên quốc gia không được sử dụng để điều chỉnh hoặc ấn định giá giao dịch liên kết.