THÔNG TƯ
HƯỚNG DẪN VỀ QUẢN LÝ HOÀN THUẾ GIÁ TRỊ GIA TĂNG
Căn cứ Luật Quản lý thuế số 78/2006/QH11 ngày
29/11/2006; Luật số 21/2012/QH13 sửa đổi, bổ sung một số Điều của Luật Quản lý
thuế ngày 20/11/2012; Luật sửa đổi, bổ sung một số Điều của các Luật về thuế số
71/2014/QH13 ngày 26/11/2014 và các văn bản hướng dẫn thi hành;
Căn cứ Luật Thuế giá trị gia tăng số
13/2008/QH12 ngày 03/6/2008; Luật sửa đổi, bổ sung một số Điều của Luật Thuế
giá trị gia tăng số 31/2013/QH13 ngày 19/6/2013; Luật sửa đổi, bổ sung một số
Điều của Luật thuế giá trị gia tăng, Luật thuế tiêu thụ đặc biệt và Luật Quản
lý thuế số 106/2016/QH13 ngày 06/4/2016 và các văn bản hướng dẫn thi hành;
Căn cứ Luật Ngân sách nhà nước số
83/2015/QH13 ngày 25/6/2015 và các văn bản hướng dẫn thi hành;
Căn cứ Nghị định số 215/2013/NĐ-CP ngày
23/12/2013 của Chính phủ quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ
chức của Bộ Tài chính;
Theo đề nghị của Tổng cục trưởng Tổng cục Thuế.
Bộ trưởng Bộ Tài chính ban hành Thông tư hướng
dẫn về quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng.
Chương I
QUY ĐỊNH CHUNG
Điều 1. Phạm vi Điều chỉnh
1. Thông tư này hướng dẫn về việc quản lý hoàn
thuế giá trị gia tăng của người nộp thuế thuộc cơ quan thuế quản lý theo quy định
của Luật Ngân sách Nhà nước, Luật Thuế giá trị gia tăng, Luật Quản lý thuế và
các văn bản hướng dẫn thi hành; bao gồm: việc tiếp nhận, giải quyết, kiểm tra,
thanh tra hoàn thuế giá trị gia tăng; quản lý kinh phí dự toán hoàn thuế giá trị
gia tăng; trách nhiệm của các cơ quan, tổ chức, cá nhân có liên quan trong việc
quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng.
2. Hoàn thuế cho hàng hóa của người nước ngoài,
người Việt Nam định cư ở nước ngoài mang theo khi xuất cảnh thực hiện theo hướng
dẫn tại Thông tư số 72/2014/TT-BTC ngày 30/5/2014 của Bộ Tài chính.
3. Hoàn trả số tiền thuế giá trị gia tăng nộp nhầm,
nộp thừa thực hiện theo quy định tại Điều 47 Luật quản lý thuế
số 78/2006/QH11 và đã được sửa đổi, bổ sung tại Khoản 13 Điều
1 Luật quản lý thuế số 21/2012/QH13 sửa đổi, bổ sung một số Điều của Luật
quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi hành.
Điều 2. Đối tượng áp dụng
1. Người nộp thuế được hoàn thuế giá
trị gia tăng theo quy định của Luật Thuế giá
trị gia tăng.
2. Cơ quan quản lý thuế gồm:
a) Tổng cục Thuế, Cục Thuế, Chi cục Thuế;
b) Tổng cục Hải quan, Cục Hải quan, Chi cục Hải
quan.
3. Vụ Ngân sách nhà nước - Bộ Tài chính.
4. Kho bạc nhà nước, Kho bạc nhà nước cấp tỉnh,
thành phố trực thuộc Trung ương, Kho bạc nhà nước cấp quận, huyện, thị xã,
thành phố trực thuộc tỉnh.
5. Cơ quan nhà nước, tổ chức, cá
nhân khác liên quan đến việc quản lý hoàn thuế giá
trị gia tăng.
Điều 3. Nguyên tắc quản lý
hoàn thuế giá trị gia tăng
1. Người nộp thuế thuộc trường hợp được hoàn thuế
theo quy định tại Luật Thuế giá trị gia tăng tự xác định số tiền thuế giá trị
gia tăng đủ Điều kiện khấu trừ, hoàn thuế, khai đề nghị hoàn thuế, lập và gửi hồ
sơ đề nghị hoàn thuế đến cơ quan thuế quản lý trực tiếp.
2. Việc giải quyết hoàn thuế được thực hiện theo
đúng quy định của pháp luật, theo trình tự, thủ tục quy định tại Điều
59 Luật Quản lý thuế số 78/2006/QH11 ngày 29/11/2006 (sau đây gọi là Luật
quản lý thuế số 78/2006/QH11) và Khoản 18 Điều 1 Luật quản lý
thuế số 21/2012/QH13 ngày 20/11/2012 sửa đổi, bổ sung một số Điều của Luật
Quản lý thuế (sau đây gọi là Luật quản lý thuế số 21/2012/QH13) và các văn bản
hướng dẫn thi hành.
3. Áp dụng nguyên tắc quản lý rủi ro trong việc
giải quyết hoàn thuế giá trị gia tăng theo quy định tại Khoản 1
Điều 1 Luật quản lý thuế số 21/2012/QH13; Khoản 2 Điều 1 Luật
sửa đổi, bổ sung một số Điều của Luật thuế giá trị gia tăng, Luật thuế tiêu thụ
đặc biệt và Luật quản lý thuế số 106/2016/QH13 ngày 06/4/2016 (sau
đây gọi là Luật số 106/2016/QH13) và các văn bản hướng dẫn thi hành.
4. Cơ quan thuế ứng dụng công nghệ thông tin
theo quy định của pháp luật về giao dịch điện tử trong việc tiếp nhận, giải quyết,
quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng và thực hiện kết nối, trao đổi thông tin với
các cơ quan có liên quan trong việc giải quyết hoàn thuế cho người nộp thuế.
Điều 4. Kinh phí hoàn thuế
giá trị gia tăng
1. Kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng được bố
trí trong dự toán ngân sách hàng năm do Quốc hội quyết định.
2. Tổng cục trưởng Tổng cục Thuế quản lý kinh
phí hoàn thuế giá trị gia tăng và Điều hành chi hoàn thuế giá trị gia tăng
trong phạm vi dự toán ngân sách đã được cấp có thẩm quyền phê duyệt.
3. Cục trưởng Cục Thuế quản lý, sử dụng kinh phí
hoàn thuế giá trị gia tăng để chi hoàn cho người nộp thuế theo thẩm quyền và chịu
trách nhiệm về việc ra quyết định hoàn thuế theo quy định của pháp luật.
Điều 5. Cơ sở dữ liệu và ứng
dụng công nghệ thông tin trong quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng
1. Cơ sở dữ liệu hoàn thuế giá trị gia tăng là hệ
thống dữ liệu thông tin về người nộp thuế thuộc đối tượng hoàn thuế giá trị gia
tăng, là một cấu phần trong hệ thống cơ sở dữ liệu quản lý thuế chung của ngành
thuế. Việc xây dựng, thu thập, xử lý, sử dụng, chia sẻ, lưu trữ, bảo mật thông
tin của cơ sở dữ liệu hoàn thuế giá trị gia tăng được thực hiện theo quy định của
pháp luật hiện hành.
2. Cơ quan thuế ứng dụng công nghệ thông tin
trong việc thực hiện quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng, bao gồm: tiếp nhận, giải
quyết hồ sơ hoàn thuế, thông báo kết quả giải quyết hồ sơ hoàn thuế, trao đổi
thông tin với các cơ quan liên quan trong giải quyết hoàn thuế giá trị gia
tăng.
Điều 6. Áp dụng quản lý rủi
ro trong quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng
1. Việc đánh giá rủi ro trong quản lý hoàn thuế
giá trị gia tăng được thực hiện theo quy định của Khoản 1 Điều
1 Luật quản lý thuế số 21/2012/QH13; Thông tư số 204/2015/TT-BTC ngày
21/12/2015 của Bộ Tài chính quy định về áp dụng quản lý rủi ro trong quản lý
thuế (sau đây gọi là Thông tư số 204/2015/TT-BTC).
2. Quản lý rủi ro trong quản lý hoàn thuế giá trị
gia tăng
a) Phân loại hồ sơ giải quyết hoàn thuế bao gồm:
hồ sơ hoàn thuế thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau và hồ sơ hoàn thuế thuộc
diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau theo quy định tại Khoản 1 Điều
1 Luật quản lý thuế số 21/2012/QH13, Khoản 3 Điều 1 Luật số
106/2016/QH13; Cơ quan thuế thực hiện kiểm tra trước hoàn thuế sau đối với
hồ sơ đề nghị hoàn thuế thuộc đối tượng rủi ro cao.
b) Xây dựng kế hoạch kiểm tra, thanh tra sau
hoàn thuế giá trị gia tăng theo quy định tại Khoản 18 Điều 1 Luật
quản lý thuế số 21/2012/QH13, Khoản 4 Điều 41 Nghị định số
83/2013/NĐ-CP: kiểm tra sau hoàn thuế được thực hiện theo nguyên tắc quản lý
rủi ro trong thời hạn mười năm, kể từ ngày có quyết định hoàn thuế.
Điều 7. Áp dụng
biện pháp nghiệp vụ hải quan đối với một số trường hợp rủi ro cao về thuế
1. Cơ quan hải quan có trách nhiệm
cung cấp thông tin Tờ khai hải quan và các thông tin có liên quan cho cơ quan
thuế qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Hải quan theo Quy chế trao đổi
thông tin và phối hợp công tác giữa cơ quan hải quan và cơ quan thuế. Cơ quan hải
quan chịu trách nhiệm về thông tin hàng hoá xuất khẩu, nhập khẩu trên Tờ khai hải
quan theo quy định về pháp luật hải quan và pháp luật về quản lý thuế.
Trường hợp Tờ khai hải quan không
có trên cơ sở dữ liệu của cơ quan hải quan cung cấp, cơ
quan thuế có văn bản đề nghị cơ quan hải quan có liên quan cung cấp để có căn cứ
giải quyết hoàn thuế giá trị gia tăng cho người nộp thuế.
2. Trên cơ sở kết quả phân tích,
đánh giá rủi ro, yêu cầu về quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng hoặc qua kiểm
tra, phát hiện có dấu hiệu vi phạm pháp luật về thuế, hải quan, cơ quan thuế có
trách nhiệm cung cấp thông tin vi phạm của người nộp thuế cho cơ quan hải quan
để thực hiện việc kiểm tra, giám sát hải quan theo quy định.
Tổng cục Thuế định kỳ hàng quý vào ngày 20 tháng sau liền kề hoặc đột xuất trong trường
hợp cần thiết gửi văn bản đề nghị Tổng cục Hải quan áp dụng tiêu chí phân luồng
để thực hiện kiểm tra, giám sát đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu thuộc diện
rủi ro cao về hoàn thuế. Văn bản đề nghị phải nêu rõ tiêu chí xác định và
phương thức kiểm tra, giám sát hàng hóa xuất nhập khẩu đối với doanh nghiệp; mặt
hàng; địa bàn, lĩnh vực hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu phù hợp với quy định của
Luật hải quan.
Trong thời hạn chậm nhất 5 (năm)
ngày làm việc kể từ khi nhận được văn bản đề nghị của Tổng cục Thuế, Tổng cục Hải
quan phải áp dụng tiêu chí phân luồng, biện pháp kiểm tra, giám sát hàng hóa xuất
nhập khẩu. Trường hợp không áp dụng hoặc có vướng mắc, Tổng cục Hải quan có văn
bản trao đổi với Tổng cục Thuế trong thời hạn nêu trên và nêu rõ lý do của việc
không hoặc chưa áp dụng.
Điều 8. Áp dụng
biện pháp nghiệp vụ quản lý hoàn thuế đối với một số trường hợp rủi ro cao về
thuế
1. Trường hợp qua kiểm tra, thanh
tra thuế phát hiện người nộp thuế mua hàng hóa, dịch vụ của người nộp thuế khác
(bên cung cấp hàng hóa, dịch vụ) có hành vi trốn thuế, gian lận thuế, cơ quan
thuế phải bổ sung kế hoạch kiểm tra, thanh tra bên cung cấp hàng hóa, dịch vụ;
hoặc đề nghị cơ quan thuế quản lý trực tiếp bên cung cấp hàng hóa, dịch vụ bổ
sung kế hoạch và thực hiện kiểm tra, thanh tra hoặc cung cấp thông tin về việc
chấp hành pháp luật thuế của bên cung cấp hàng hóa, dịch vụ để có căn cứ giải
quyết hoàn thuế.
2. Trường hợp người nộp thuế có
giao dịch thanh toán liên quan đến tổ chức, cá nhân có giao dịch đáng ngờ theo
danh sách cảnh báo của cơ quan thanh tra, giám sát ngân hàng; hoặc qua kiểm
tra, thanh tra thuế phát hiện người nộp thuế có chứng từ thanh toán qua ngân
hàng có nội dung chưa đầy đủ, chưa đúng quy định:
a) Cơ quan thuế có văn bản yêu cầu
tổ chức tín dụng, tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán có liên quan
cung cấp thông tin (bao gồm cả sổ phụ tài Khoản) của người trả (hoặc chuyển) tiền,
người thụ hưởng số tiền trên chứng từ (hoặc cá nhân liên quan đến người thụ hưởng)
để có căn cứ giải quyết hoàn thuế giá trị gia tăng;
b) Cơ quan thuế có văn bản đề nghị
cơ quan hải quan cửa khẩu cung cấp thông tin về lượng tiền mặt (ngoại tệ hoặc đồng
Việt Nam) mang qua cửa khẩu vào Việt Nam trong thời hạn 5 (năm) ngày làm việc kể
từ ngày nhận được văn bản đề nghị của cơ quan thuế để có căn cứ giải quyết hoàn
thuế giá trị gia tăng đối với hàng hóa xuất khẩu qua biên giới đất liền theo
quy định.
3. Trường hợp qua kiểm tra, thanh
tra thuế phát hiện người nộp thuế có dấu hiệu trốn thuế, gian lận thuế theo quy
định của pháp luật về thuế và có dấu hiệu tội phạm, cơ quan thuế chuyển hồ sơ
cho cơ quan công an để xử lý theo quy định của Bộ Luật tố tụng hình sự.
4. Quá thời hạn
kiểm tra, thanh tra thuế nhưng cơ quan thuế chưa nhận được kết quả trả lời, xác
minh của các cơ quan có liên quan nêu tại Điều này thì:
a) Trường hợp hồ sơ thuộc diện kiểm
tra trước, hoàn thuế sau, cơ quan thuế kiểm tra xác định số thuế đủ Điều kiện
được hoàn khác số thuế đề nghị hoàn thì xử lý như sau:
- Nếu số thuế đề nghị hoàn lớn
hơn số thuế đủ Điều kiện được hoàn thì người nộp thuế được hoàn bằng số thuế đủ
Điều kiện được hoàn.
- Nếu số thuế đề nghị hoàn nhỏ
hơn số thuế đủ Điều kiện được hoàn thì người nộp thuế được hoàn bằng số thuế đề
nghị hoàn.
Trường hợp cơ quan thuế xác định
số thuế đủ Điều kiện được hoàn thì giải quyết hoàn số thuế đã đủ Điều kiện
hoàn, không chờ kiểm tra xác minh toàn bộ hồ sơ mới thực hiện hoàn thuế; đối với
số thuế cần kiểm tra xác minh, yêu cầu người nộp thuế giải trình, bổ sung hồ sơ
thì xử lý hoàn thuế khi có đủ Điều kiện theo quy định.
b) Trường hợp kiểm tra, thanh tra
sau hoàn thuế, cơ quan thuế phải kết thúc kiểm tra, thanh tra đúng thời hạn quy
định. Đối với số tiền thuế đã hoàn đang chờ kết quả trả lời, xác minh của các
cơ quan có liên quan, cơ quan thuế phải nêu rõ trong biên bản kiểm tra, kết luận
thanh tra về việc chưa đủ căn cứ kết luận số tiền thuế đủ Điều kiện hoàn thuế.
Khi có kết quả trả lời, xác minh của các cơ quan có liên quan, cơ quan thuế xác
định số tiền thuế đã hoàn không đủ Điều kiện hoàn thuế thì có quyết định thu hồi
số thuế đã hoàn và xử phạt người nộp thuế theo quy định của pháp luật.
Điều 9. Trách nhiệm của cơ
quan thuế trong việc tiếp nhận, giải quyết hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng
1. Cơ quan thuế quản lý trực tiếp người nộp thuế
có trách nhiệm tiếp nhận hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng của người nộp thuế.
2. Cục Thuế có trách nhiệm giải quyết hồ sơ hoàn
thuế của người nộp thuế, bao gồm: phân loại hồ sơ hoàn thuế; xác định số thuế
giá trị gia tăng được hoàn của người nộp thuế; xác định số tiền thuế nợ, tiền
phạt, tiền chậm nộp phải bù trừ với số thuế giá trị gia tăng được hoàn của người
nộp thuế; đề xuất hoàn thuế; thẩm định hồ sơ hoàn thuế; ban hành quyết định
hoàn thuế; thực hiện chi hoàn thuế cho người nộp thuế trừ trường hợp quy định tại
Khoản 3 Điều này.
3. Chi cục Thuế quản lý trực tiếp người nộp thuế
trực thuộc các Cục Thuế thành phố Hà Nội, thành phố Hồ Chí Minh, tỉnh Bình
Dương, tỉnh Đồng Nai được thực hiện các công việc sau: phân loại hồ sơ hoàn thuế;
xác định số thuế giá trị gia tăng được hoàn của người nộp thuế; xác định số tiền
thuế nợ, tiền phạt, tiền chậm nộp phải bù trừ với số thuế giá trị gia tăng được
hoàn của người nộp thuế; đề xuất số tiền được hoàn thuế trước khi chuyển hồ sơ
gửi Cục Thuế thực hiện thẩm định hồ sơ hoàn thuế; ban hành quyết định hoàn thuế;
thực hiện chi hoàn thuế cho người nộp thuế.
Chương II
QUY TRÌNH GIẢI QUYẾT
HOÀN THUẾ GIÁ TRỊ GIA TĂNG
Điều 10. Lập
và gửi hồ sơ hoàn thuế
1. Hồ sơ hoàn thuế giá trị gia
tăng gồm:
- Giấy đề nghị hoàn trả Khoản
thu ngân sách nhà nước (mẫu 01/ĐNHT
ban hành kèm theo Thông tư hướng dẫn Luật Quản lý thuế số
156/2013/TT-BTC ngày 06/11/2013 của Bộ Tài chính) (sau
đây gọi là Thông tư số 156/2013/TT-BTC).
- Các tài liệu khác theo quy định
tại các Điều từ Điều 50 đến Điều 56 (trừ Điều 53) của Thông tư
số 156/2013/TT-BTC.
2. Người nộp
thuế là doanh nghiệp, tổ chức đáp ứng đầy đủ các Điều kiện về khấu trừ, hoàn
thuế giá trị gia tăng theo quy định của pháp luật về thuế giá trị gia tăng và
pháp luật về quản lý thuế, lập và gửi hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng đến cơ
quan thuế quản lý trực tiếp người nộp thuế.
Chi nhánh, đơn vị phụ thuộc của người nộp thuế
theo quy định tại Khoản 1 Điều 45 Luật Doanh nghiệp số
68/2014/QH13 và không phải là đơn vị kế toán lập báo cáo tài chính theo quy
định tại Khoản 4 Điều 3 Luật Kế toán số 88/2015/QH13, khi
đề nghị hoàn thuế giá trị gia tăng phải có văn bản ủy quyền của doanh nghiệp trụ
sở chính theo quy định của pháp luật về uỷ quyền.
3. Người nộp thuế được gửi hồ
sơ hoàn thuế điện tử hoặc nộp trực tiếp tại cơ quan thuế hoặc gửi qua đường bưu
chính. Cụ thể:
a) Người nộp thuế gửi hồ sơ
hoàn thuế điện tử qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế kể từ thời Điểm
cơ quan thuế chấp nhận giao dịch hoàn thuế điện tử theo quy định tại Thông tư số
110/2015/TT-BTC ngày 28/7/2015 của Bộ Tài chính hướng dẫn giao dịch điện tử
trong lĩnh vực thuế (sau đây gọi là Thông tư số 110/2015/TT-BTC).
b) Người nộp thuế gửi trực tiếp
hồ sơ hoàn thuế bằng giấy hoặc gửi qua đường bưu chính đến cơ quan thuế quản lý
trực tiếp người nộp thuế.
4. Người nộp thuế đã gửi hồ sơ
đề nghị hoàn thuế đến cơ quan thuế nhưng sau đó có văn bản hủy đề nghị hoàn thuế
thì người nộp thuế được khai Điều chỉnh, bổ sung số thuế đề nghị hoàn chuyển khấu
trừ tiếp vào tờ khai thuế giá trị gia tăng của kỳ kê khai tiếp theo kể từ thời
Điểm có văn bản hủy đề nghị hoàn thuế, nếu đáp ứng đủ Điều kiện khấu trừ thuế
giá trị gia tăng.
Điều 11.
Tiếp nhận hồ sơ hoàn thuế
1. Nhận hồ sơ hoàn thuế điện tử
a) Cổng thông tin điện tử của Tổng
cục Thuế tự động nhận hồ sơ hoàn thuế điện tử của người nộp thuế.
b) Hệ thống ứng dụng quản lý
thuế tự động ghi nhận hồ sơ hoàn thuế điện tử của người nộp thuế và chuyển đến
cơ quan thuế giải quyết hồ sơ hoàn thuế theo quy định tại Khoản
2, Khoản 3 Điều 9 Thông tư này; đồng thời gửi Thông báo xác nhận nộp hồ sơ
hoàn thuế điện tử (mẫu số 01/TB-TĐT
ban hành kèm theo Thông tư số 110/2015/TT-BTC) cho người nộp thuế, cơ quan thuế
quản lý trực tiếp người nộp thuế qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế.
2. Nhận hồ sơ hoàn thuế bằng giấy
a) Hồ sơ nộp trực tiếp tại cơ
quan thuế:
Bộ phận “một cửa” của cơ quan
thuế quản lý trực tiếp người nộp thuế nhận hồ sơ hoàn thuế, kiểm tra tính đầy đủ
của hồ sơ theo quy định. Trường hợp hồ sơ chưa đầy đủ, bộ phận “một cửa” thông
báo, hướng dẫn người nộp thuế để hoàn chỉnh hồ sơ. Trường hợp hồ sơ đầy đủ, bộ
phận “một cửa” ghi sổ nhận hồ sơ hoàn thuế trên Hệ thống ứng dụng quản lý thuế.
b) Hồ sơ nộp qua đường bưu
chính:
Bộ phận hành chính văn thư của
cơ quan thuế quản lý trực tiếp người nộp thuế nhận hồ sơ hoàn thuế của người nộp
thuế, ghi sổ văn thư theo quy định, chuyển bộ phận “một cửa” để xử lý theo quy
định tại Điểm a Khoản này.
c) Chi cục Thuế gửi hồ sơ hoàn
thuế cho Cục Thuế có trách nhiệm giải quyết hồ sơ hoàn thuế theo quy định tại Khoản 2 Điều 9 Thông tư này ngay trong ngày làm việc hoặc chậm
nhất ngày làm việc tiếp theo liền kề trừ trường hợp quy định tại Điểm d Khoản
này.
d) Đối với Chi cục Thuế trực tiếp
giải quyết hồ sơ hoàn thuế theo quy định tại Khoản 3 Điều 9
Thông tư này: bộ phận “một cửa” chuyển hồ sơ hoàn thuế cho bộ phận giải quyết
hồ sơ hoàn thuế của Chi cục Thuế ngay trong ngày làm việc hoặc chậm nhất ngày
làm việc tiếp theo liền kề.
3. Thời Điểm tiếp nhận hồ sơ
hoàn thuế
a) Đối với hồ sơ hoàn thuế điện
tử: là ngày ghi trên Thông báo xác nhận nộp hồ sơ hoàn thuế điện tử quy định tại
Điểm b, Khoản 1 Điều này.
b) Đối với hồ sơ được nộp trực
tiếp tại cơ quan thuế hoặc gửi qua đường bưu chính: là ngày nộp hồ sơ hoàn thuế
được xác định theo hướng dẫn tại Điểm b và Điểm c Khoản 1 Điều
58 Thông tư số 156/2013/TT-BTC.
Điều 12.
Phân loại hồ sơ hoàn thuế
1. Cơ quan thuế thực hiện phân loại hồ sơ hoàn
thuế giá trị gia tăng theo quy định tại Khoản 1, Khoản 18 Điều
1 Luật quản lý thuế số 21/2012/QH13; Khoản 3 Điều 1 Luật số
106/2016/QH13, cụ thể như sau:
a) Hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau là hồ sơ thuộc một trong các trường hợp
sau đây:
- Hoàn thuế theo quy định của Điều ước quốc tế
mà nước Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam là thành viên, trừ trường hợp hoàn
thuế theo Hiệp định tránh đánh thuế hai lần của các hãng vận tải nước ngoài.
- Người nộp thuế đề nghị hoàn thuế lần đầu.
Trường hợp người nộp thuế có hồ sơ hoàn thuế gửi
cơ quan quản lý thuế lần đầu nhưng không thuộc diện được hoàn thuế theo quy định
thì lần đề nghị hoàn thuế kế tiếp vẫn xác định là đề nghị hoàn thuế lần đầu.
- Người nộp thuế đề nghị hoàn thuế trong thời hạn
02 (hai) năm, kể từ thời Điểm bị cơ quan quản lý thuế xử lý về hành vi trốn thuế,
gian lận về thuế.
Trường hợp người nộp thuế có nhiều lần đề nghị
hoàn thuế trong thời hạn 02 (hai) năm, nếu trong lần đề nghị hoàn thuế đầu tiên
tính từ sau thời Điểm bị xử lý về hành vi trốn thuế, gian lận về thuế, cơ quan
thuế kiểm tra hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế không có hành vi khai sai dẫn
đến thiếu số tiền thuế phải nộp hoặc tăng số tiền thuế được hoàn quy định tại Khoản 33 Điều 1 Luật quản lý thuế số 21/2012/QH13, hoặc hành
vi trốn thuế, gian lận thuế quy định tại Điều 108 Luật quản lý
thuế và Khoản 34 Điều 1 Luật quản lý thuế số 21/2012/QH13
thì những lần đề nghị hoàn thuế tiếp theo, hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế
không thuộc diện kiểm tra trước khi hoàn thuế. Trường hợp phát hiện những lần đề
nghị hoàn thuế tiếp theo, người nộp thuế có hành vi khai sai đối với hồ sơ hoàn
thuế, hành vi trốn thuế, gian lận về thuế quy định tại Khoản
33, Khoản 34 Điều 1 Luật quản lý thuế số 21/2012/QH13, Điều
108 Luật quản lý thuế số 78/2006/QH11 thì hồ sơ đề nghị hoàn thuế vẫn thuộc
diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau theo đúng thời hạn 02 (hai) năm, kể từ thời
Điểm bị xử lý về hành vi trốn thuế, gian lận về thuế.
- Người nộp thuế sản xuất, kinh
doanh hàng hóa xuất khẩu đề nghị hoàn thuế trong thời hạn 02
(hai) năm, kể từ thời Điểm bị cơ quan quản lý nhà nước xử lý đối
với hành vi buôn lậu, vận chuyển trái phép hàng hóa qua biên giới, gian lận
thương mại.
Cơ quan thuế căn cứ thông tin về
Quyết định xử phạt của cơ quan quản lý nhà nước có liên quan về hành vi buôn lậu,
vận chuyển trái phép hàng hoá qua biên giới, gian lận thương mại trên cơ sở dữ
liệu quản lý hoàn thuế tại thời Điểm đánh giá để căn cứ phân loại hồ sơ hoàn
thuế thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau. Thời Điểm 02 (hai) năm được tính
kể từ ngày cơ quan quản lý nhà nước có Quyết định xử phạt về một trong các hành
vi buôn lậu, vận chuyển trái phép hàng hoá qua biên giới, gian lận thương mại tại
thời Điểm đánh giá.
- Doanh nghiệp sáp nhập, hợp nhất, chia tách, giải
thể, phá sản, chuyển đổi hình thức sở hữu, chấm dứt hoạt động; giao, bán,
khoán, cho thuê doanh nghiệp nhà nước;
- Người nộp thuế thuộc đối tượng rủi ro cao theo
quy định của Luật quản lý thuế là các trường hợp người nộp thuế được đánh giá xếp
hạng rủi ro cao, rủi ro rất cao, người nộp thuế có thời gian hoạt động dưới 12
tháng hướng dẫn tại Thông tư số 204/2015/TT-BTC .
- Hết thời hạn theo thông báo bằng văn bản của
cơ quan thuế nhưng người nộp thuế không giải trình, bổ sung thông tin tài liệu
theo thông báo của cơ quan thuế hoặc có giải trình, bổ sung nhưng không chứng
minh được số thuế đã khai là đúng.
b) Hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước,
kiểm tra sau là các hồ sơ không thuộc Điểm a Khoản này.
2. Trường hợp kết quả phân
loại hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau, cơ quan thuế
gửi Thông báo về việc chuyển hồ sơ hoàn thuế sang diện kiểm tra trước, hoàn thuế
sau (mẫu số 01/HT-TB ban hành
kèm theo Thông tư số 156/2013/TT-BTC) cho người nộp thuế trong
thời hạn 06 (sáu) ngày làm việc kể từ ngày tiếp nhận đủ hồ sơ đề nghị hoàn thuế
theo quy định tại Điểm a Khoản 3 Điều 58 Thông tư số
156/2013/TT-BTC. Trường hợp người nộp thuế thực hiện hoàn thuế
điện tử, thông báo được gửi cho người nộp thuế qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế.
Điều 13. Xác định số thuế
giá trị gia tăng được hoàn của người nộp thuế
1. Đối với hồ sơ hoàn thuế
thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau
Cơ quan thuế căn cứ hồ sơ hoàn thuế
của người nộp thuế và thông tin về người nộp thuế do cơ quan thuế quản lý tại
cơ sở dữ liệu hoàn thuế giá trị gia tăng để kiểm tra đối tượng và trường
hợp được hoàn thuế, cụ thể:
a) Trường hợp hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế
không thuộc đối tượng và trường hợp hoàn thuế theo quy định tại Luật Thuế giá
trị gia tăng, Luật Quản lý thuế, trong thời hạn chậm nhất không quá 03 (ba)
ngày làm việc, kể từ ngày nhận được đủ hồ sơ, cơ quan thuế ban hành Thông báo về
việc không được hoàn thuế (mẫu số 02/HT-TB ban hành kèm theo
Thông tư số 156/2013/TT-BTC) gửi cho người nộp thuế. Trường hợp người nộp thuế
thực hiện hoàn thuế điện tử, Thông báo được gửi qua Cổng thông tin điện tử của
Tổng cục Thuế.
b) Trường hợp hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế
thuộc đối tượng và trường hợp được hoàn thuế, cơ quan thuế thực hiện đối chiếu số tiền thuế giá trị gia tăng đề nghị hoàn tại hồ sơ hoàn thuế
với hồ sơ khai thuế của người nộp thuế. Số tiền thuế giá trị gia tăng được hoàn phải đảm bảo đã được
khai thuế theo đúng quy định của Luật quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi
hành; đảm bảo Điều kiện khấu trừ, hoàn thuế quy định tại Khoản
6, Khoản 7 Điều 1 Luật thuế giá trị gia tăng số 31/2013/QH13 ngày 19/6/2013
(sau đây gọi là Luật thuế giá trị gia tăng số 31/2013/QH13) và các văn bản hướng
dẫn thi hành.
c) Trường hợp chưa đủ thông tin để xác định hồ
sơ hoàn thuế của người nộp thuế thuộc đối tượng và trường hợp được hoàn thuế,
cơ quan thuế lập và gửi Thông báo giải trình, bổ sung thông
tin, tài liệu (mẫu số 01/KTTT ban
hành kèm theo Thông tư 156/2013/TT-BTC) theo quy định tại Khoản 2 Điều 60 Thông tư 156/2013/TT-BTC gửi người
nộp thuế trong thời hạn chậm nhất không quá 03 (ba) ngày
làm việc kể từ ngày cơ quan thuế tiếp nhận hồ sơ đề nghị hoàn thuế của
người nộp thuế. Trường hợp người nộp thuế thực hiện hoàn thuế điện tử, Thông
báo được gửi qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế. Trong
thời hạn 10 (mười) ngày làm việc kể từ ngày cơ quan thuế có Thông báo, người nộp
thuế có trách nhiệm gửi các giải trình hoặc bổ sung thông tin, tài liệu theo
thông báo của cơ quan thuế. Quá thời hạn nêu trên, cơ quan thuế chuyển hồ
sơ hoàn thuế sang diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau.
- Trường hợp thông tin liên quan đến xác định số
thuế giá trị gia tăng được hoàn thuộc trách nhiệm quản lý của cơ quan nhà nước
đã có quy chế trao đổi thông tin và phối hợp công tác với cơ quan thuế thì cơ
quan thuế không được yêu cầu người nộp thuế giải trình, bổ sung thông tin, tài
liệu.
- Trường hợp người nộp thuế đã giải trình, bổ
sung thông tin, tài liệu nhưng không chứng minh được số thuế đã khai là đúng hoặc
quá thời hạn yêu cầu của cơ quan thuế nhưng không giải trình, bổ sung hồ sơ
hoàn thuế theo quy định tại Khoản 2 Điều 58 Thông tư số
156/2013/TT-BTC: Thủ trưởng cơ quan thuế chịu trách nhiệm phê duyệt thay đổi
phân loại hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm
tra sau sang thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau; đồng thời gửi Thông báo
về việc chuyển hồ sơ sang diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau (mẫu số 01/HT-TB ban hành kèm theo
Thông tư số 156/2013/TT-BTC) cho người nộp thuế biết trong thời hạn 06 (sáu)
ngày làm việc kể từ ngày tiếp nhận hồ sơ theo quy định tại Điểm
a Khoản 3 Điều 58 Thông tư số 156/2013/TT-BTC.
d) Khoảng thời gian kể từ ngày cơ
quan thuế phát hành thông báo đề nghị giải trình, bổ sung đến ngày cơ quan thuế
nhận được văn bản giải trình, bổ sung của người nộp thuế không tính trong thời
hạn giải quyết hồ sơ hoàn thuế của cơ quan thuế.
2. Đối
với hồ sơ hoàn thuế thuộc diện kiểm tra trước,
hoàn thuế sau
a) Cơ quan
thuế thực hiện kiểm tra, thanh tra tại trụ sở của người nộp thuế theo quy định
tại các Điều 78, Điều 79, Điều 80 Luật quản lý thuế số 78/2006/QH11 và các văn bản hướng dẫn thi hành,
theo quy trình kiểm tra thuế, quy trình thanh tra của ngành thuế. Căn cứ kết quả
kiểm tra thuế, thanh tra thuế, cơ quan thuế xác định số thuế được hoàn của người
nộp thuế. Số tiền thuế giá trị gia
tăng được hoàn phải đảm bảo đã được khai thuế theo đúng
quy định của Luật quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi hành; đảm bảo Điều
kiện khấu trừ, hoàn thuế quy định tại Khoản 6, Khoản 7 Điều 1
Luật thuế giá trị gia tăng số 31/2013/QH13 và
các văn bản hướng dẫn thi hành.
b) Trong quá
trình thực hiện kiểm tra thuế, thanh tra thuế, cơ quan thuế áp dụng các biện
pháp theo quy định tại Điều 7, Điều 8 Thông tư này để có căn
cứ xác định số tiền thuế giá trị gia tăng đủ Điều kiện hoàn của người nộp thuế.
3. Trong quá trình giải quyết hoàn thuế mà cơ quan thuế qua
công tác kiểm tra, thanh tra thuế phát hiện người nộp thuế có dấu hiệu vi phạm pháp luật và đã chuyển hồ
sơ cho cơ quan công an Điều tra hoặc người nộp thuế bị cơ quan nhà nước có thẩm
quyền thu giữ sổ sách kế toán, hóa đơn chứng từ liên quan đến số thuế đề nghị
hoàn thì cơ quan thuế phải thông
báo cho người nộp thuế về việc hồ sơ chưa đủ Điều kiện hoàn thuế. Cơ quan thuế thực hiện giải quyết hoàn thuế khi có kết quả hoặc
ý kiến của cơ quan công an hoặc của cơ quan có thẩm quyền hoặc khi có đủ hồ sơ
theo quy định.
Điều 14. Xác
định số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt còn nợ được bù trừ với số tiền thuế
giá trị gia tăng được hoàn
1. Cơ quan thuế có trách nhiệm xác định số tiền
thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt và các Khoản thu khác còn nợ ngân sách nhà nước
(sau đây gọi là tiền thuế nợ) để thực hiện bù trừ với số tiền thuế giá trị gia
tăng được hoàn của người nộp thuế.
2. Tiền thuế nợ của người nộp thuế phải bù trừ
(không bao gồm tiền thuế nợ đang thực hiện thủ tục để xoá nợ, tiền thuế nợ được
nộp dần theo quy định tại Điều 32, 39 Nghị định số
83/2013/NĐ-CP ngày 22/7/2013 của Chính phủ quy định chi Tiết thi hành một số
Điều của Luật Quản lý thuế và Luật sửa đổi, bổ sung một số Điều của Luật Quản
lý thuế), bao gồm:
a) Tiền thuế nợ do ngành Thuế quản lý trên Hệ thống
ứng dụng quản lý thuế;
b) Tiền thuế nợ (trừ tiền
phí, tiền lệ phí hải quan) do cơ quan hải quan cung cấp theo Quy chế trao đổi
thông tin và phối hợp công tác giữa cơ quan hải quan và cơ quan thuế;
c) Tiền thuế nợ Ngân sách nhà nước theo văn bản
đề nghị của các cơ quan, tổ chức có thẩm quyền theo quy định của pháp luật.
3. Sau khi đã bù trừ theo
quy định tại Khoản 2 Điều này, trường hợp người nộp thuế là doanh nghiệp trụ sở
chính vẫn có số thuế còn được hoàn trả nhưng có Chi nhánh hạch toán phụ thuộc
có số tiền thuế nợ quá hạn trên 90 ngày do cơ quan thuế quản lý trên Hệ thống ứng
dụng quản lý thuế thì cơ quan thuế phải tiếp tục thực hiện bù trừ. Trường hợp
nhiều Chi nhánh hạch toán phụ thuộc có số tiền thuế nợ thì thứ tự bù trừ ưu
tiên cho Khoản nợ có hạn nộp xa nhất của Chi nhánh.
Trường hợp Chi nhánh hạch toán phụ thuộc có số
thuế còn được hoàn thì phải thực hiện bù trừ với số tiền thuế nợ quá hạn trên
90 ngày của doanh nghiệp trụ sở chính.
4. Cơ quan thuế quản lý trực tiếp người nộp thuế
phải chịu trách nhiệm về số tiền thuế nợ trên Hệ thống ứng dụng quản lý thuế;
cơ quan, tổ chức có đề nghị số tiền thuế nợ Ngân sách nhà nước được bù trừ phải
chịu trách nhiệm về số liệu đã cung cấp cho cơ quan thuế.
5. Trường hợp người nộp thuế có văn bản đề nghị
cơ quan thuế trích số tiền thuế được hoàn nộp thay tiền thuế nợ ngân sách ngân
sách nhà nước cho người nộp thuế khác, cơ quan thuế xác định số tiền thuế được
hoàn bù trừ với số tiền thuế nợ của người nộp thuế khác (sau khi bù trừ số tiền
thuế nợ của người nộp thuế quy định tại Khoản 2, Khoản 3 Điều này).
6. Sau khi nhận được Quyết định hoàn thuế kiêm
bù trừ thu ngân sách nhà nước theo quy định tại Điều này, người nộp thuế có vướng
mắc về số tiền thuế nợ đã bù trừ với số tiền thuế được hoàn thì cơ quan thuế quản
lý trực tiếp người nộp thuế, cơ quan hải quan, cơ quan, tổ chức đề nghị bù trừ
nợ có trách nhiệm giải quyết vướng mắc cho người nộp thuế.
Trường hợp số tiền thuế nợ đã bù trừ cao hơn số
tiền thuế nợ thực tế thì được xác định là Khoản nộp thừa. Cơ quan thuế, cơ quan
hải quan xử lý theo quy định tại Khoản 13 Điều 1 Luật số
21/2012/QH13 hoặc cơ quan, tổ chức đề nghị số tiền thuế nợ bù trừ xử lý
theo quy định của pháp luật có liên quan.
Điều 15. Đề
xuất hoàn thuế
1. Cơ quan thuế căn cứ kết quả xác định số tiền thuế giá trị gia tăng được hoàn, số tiền
thuế giá trị gia tăng không được hoàn, số tiền thuế nợ phải bù trừ, số tiền thuế
giá trị gia tăng còn được hoàn trả cho người nộp thuế, thực hiện lập đề xuất
hoàn thuế và dự thảo Quyết định hoàn thuế (hoặc Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ
thu ngân sách nhà nước), Thông báo về việc không được hoàn thuế (nếu có).
2. Cơ quan thuế phải tổ chức
kiểm tra, cập nhật trên Hệ thống ứng dụng quản lý thuế đối với: hồ
sơ khai thuế giá trị gia tăng, hồ sơ hoàn thuế, Biên bản kiểm tra hoàn thuế (nếu
có), Quyết định về việc xử lý thuế qua thanh tra, kiểm tra việc chấp hành pháp
luật thuế (nếu có), Phiếu đề xuất hoàn thuế, dự thảo Quyết định hoàn thuế (hoặc
Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ thu ngân sách nhà nước), Thông báo về việc
không được hoàn thuế (nếu có).
Điều 16. Thẩm
định hồ sơ hoàn thuế
1. Cơ quan thuế tổ chức thẩm định hồ sơ hoàn thuế đối với: Phiếu đề xuất hoàn thuế, dự thảo Quyết
định hoàn thuế (hoặc Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ thu ngân sách nhà nước),
Thông báo về việc không được hoàn thuế (nếu có) trước khi ban hành Quyết định
hoàn thuế (hoặc Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ thu ngân sách nhà nước).
Thời hạn hoàn thành việc thẩm định
hoàn thuế là: 01 (một) ngày làm việc đối với hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước,
kiểm tra sau; 03 (ba) ngày làm việc đối với hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước,
hoàn thuế sau kể từ thời Điểm tiếp nhận đầy đủ hồ sơ đề nghị thẩm định.
2. Cục Thuế thực hiện thẩm định về
thủ tục hoàn thuế, hồ sơ hoàn thuế, đối tượng và trường hợp được hoàn thuế, thẩm
quyền ban hành quyết định hoàn thuế và nội dung khác có liên quan.
a) Trường hợp qua thẩm định phát
hiện vấn đề chưa rõ, chưa đầy đủ, cơ quan thuế phải tổ chức trao đổi, làm rõ giữa
các bộ phận liên quan đến giải quyết hồ sơ hoàn thuế để thống nhất các nội dung
liên quan đến thẩm định hoàn thuế trong thời hạn thẩm định hồ sơ hoàn thuế; hoặc
từ chối thẩm định hồ sơ hoàn thuế đối với hồ sơ chưa đầy đủ, chưa cập nhật vào
Hệ thống ứng dụng quản lý thuế theo quy định tại Điều 15 Thông
tư này.
b) Trường hợp kết quả thẩm định
xác định thủ tục hoàn thuế, hồ sơ hoàn thuế, đối tượng và trường hợp được hoàn
thuế, thẩm quyền ban hành quyết định hoàn thuế phù hợp với quy định, cơ quan
thuế thực hiện cập nhật kết quả thẩm định hoàn thuế giá trị gia tăng vào Hệ thống
ứng dụng quản lý thuế.
Điều 17. Giám
sát hồ sơ hoàn thuế
1. Căn cứ quy định nghiệp vụ về quản
lý thuế, quy trình hoàn thuế, cơ sở dữ liệu về quản lý hoàn thuế giá trị gia
tăng, Tổng cục trưởng Tổng cục Thuế xây dựng hệ thống giám sát tự động việc giải
quyết hoàn thuế giá trị gia tăng của cơ quan thuế phù hợp với từng giai đoạn hiện
đại hoá hệ thống quản lý thuế đảm bảo đầy đủ, chính xác, đúng quy định về quản
lý thuế.
2. Tổng cục Thuế thực hiện giám
sát tự động đối với hồ sơ hoàn thuế trên Hệ thống ứng dụng quản lý thuế. Trong
quá trình giám sát, trường hợp Hệ thống ứng dụng quản lý thuế xác định hồ sơ
không đảm bảo các Điều kiện ban hành Quyết định hoàn thuế/ Quyết định hoàn thuế
kiêm bù trừ thu ngân sách nhà nước, Hệ thống ứng dụng quản lý thuế tự động
thông báo rõ lý do và công việc phải thực hiện tiếp theo để Cục Thuế căn cứ thực
hiện hoặc thông báo cho người nộp thuế thực hiện.
3. Kết quả giám sát phải được cập
nhật tự động vào Hệ thống ứng dụng quản lý thuế.
Điều 18. Ban
hành quyết định hoàn thuế
1. Căn cứ kết quả thẩm định và
giám sát hồ sơ hoàn thuế theo quy định tại Điều 16, Điều 17 Thông
tư này, Cục trưởng Cục Thuế xem xét ký ban hành Quyết định hoàn thuế (theo
mẫu số 01/QĐ-HT)/
Quyết định hoàn kiêm bù trừ Khoản thu ngân sách nhà nước (theo mẫu số 02/QĐ-HT),
Thông báo về việc không được hoàn thuế (theo mẫu số 02/HT-TB) quy định
tại Thông tư 156/2013/TT-BTC. Cục trưởng Cục Thuế chịu trách nhiệm
về quyết định hoàn thuế theo quy định của pháp luật.
2. Thời hạn ban hành Quyết định hoàn thuế/ Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ thu ngân
sách nhà nước chậm nhất không quá 06 (sáu) ngày làm việc đối với hồ sơ hoàn thuế thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau; 40 (bốn mươi) ngày đối với hồ sơ hoàn thuế thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau kể từ ngày nhận được đủ hồ sơ hoàn
thuế của người nộp thuế.
3. Quyết định hoàn thuế được gửi
cho người nộp thuế, cơ quan, tổ chức có liên quan. Trường hợp người nộp thuế thực
hiện hoàn thuế điện tử, Quyết định hoàn thuế/ Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ
Khoản thu ngân sách nhà nước được gửi qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục
Thuế theo quy định tại Điều 28 Thông tư 110/2015/TT-BTC .
Điều 19. Chi
hoàn thuế cho người nộp thuế
1. Căn cứ Quyết định hoàn thuế/
Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ Khoản thu ngân sách nhà nước, Cục Thuế thực hiện
lập Lệnh hoàn trả Khoản thu ngân sách nhà nước/ Lệnh hoàn trả kiêm bù trừ Khoản
thu ngân sách nhà nước ban hành kèm theo Thông tư số 08/2013/TT-BTC hướng dẫn
thực hiện kế toán nhà nước áp dụng cho Hệ thống thông tin quản lý ngân sách và
nghiệp vụ Kho bạc ngày 10/1/2013 của Bộ Tài chính (đã được sửa đổi, bổ sung tại
Quyết định số 759/QĐ-BTC ngày 16/4/2013 của Bộ Tài chính về việc đính chính
Thông tư số 08/2013/TT-BTC), gửi Kho bạc nhà nước cấp tỉnh kèm theo Quyết định
hoàn thuế/Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ Khoản thu ngân sách nhà nước.
Trường hợp người nộp thuế bù trừ số thuế được hoàn với số tiền thuế nợ của người nộp thuế khác
theo quy định tại Khoản 3, Khoản 5 Điều 14 Thông tư này, cơ
quan thuế lập Lệnh hoàn trả kiêm bù trừ Khoản thu ngân sách nhà nước, trong đó
ghi thông tin: tên người nộp thuế, mã số thuế của người nộp thuế được bù trừ
Khoản thu ngân sách nhà nước để Kho bạc Nhà nước có căn cứ hạch toán thu ngân
sách nhà nước.
2. Kho bạc Nhà nước cấp tỉnh tiếp
nhận Quyết định hoàn thuế và Lệnh hoàn trả Khoản thu ngân sách nhà nước (hoặc
Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ thu ngân sách nhà nước và Lệnh hoàn trả kiêm
bù trừ Khoản thu ngân sách nhà nước) do Cục Thuế gửi đến, thực hiện các nội
dung sau:
a) Đối chiếu Quyết định hoàn thuế
và Lệnh hoàn trả Khoản thu ngân sách nhà nước (hoặc Quyết định hoàn thuế kiêm
bù trừ thu ngân sách nhà nước và Lệnh hoàn trả kiêm bù trừ thu ngân sách nhà nước),
đảm bảo thống nhất thông tin về số tiền, tên người nộp thuế được nhận tiền hoàn
thuế, địa chỉ ngân hàng, thông tin về tài Khoản và ngân hàng; thông tin hạch
toán thu ngân sách nhà nước.
b) Kiểm tra tính hợp pháp của Lệnh
hoàn trả Khoản thu ngân sách nhà nước/ Lệnh hoàn trả kiêm bù trừ thu ngân sách
nhà nước đảm bảo khớp đúng mẫu dấu, chữ ký (hoặc kiểm tra việc xác thực thành
công chữ ký điện tử bằng hệ thống thông tin của Kho bạc Nhà nước) .
c) Thực hiện
hoàn thuế cho người nộp thuế trong thời hạn chậm nhất 03 (ba) ngày làm việc kể
từ ngày nhận được Lệnh hoàn trả Khoản thu ngân sách nhà nước/ Lệnh hoàn trả
kiêm bù trừ Khoản thu ngân sách nhà nước do cơ quan thuế chuyển đến.
3. Kho bạc Nhà nước cấp tỉnh luân
chuyển các liên chứng từ Lệnh hoàn trả Khoản thu ngân sách nhà nước/ Lệnh hoàn
trả kiêm bù trừ Khoản thu ngân sách nhà nước theo quy định tại Thông tư số
08/2013/TT-BTC và các văn bản hướng dẫn thực hiện cho cơ quan thuế đồng cấp
ngay trong ngày hạch toán hoặc chậm nhất ngày làm việc tiếp theo liền kề.
Trường hợp cơ quan thuế, Kho bạc
Nhà nước đã thực hiện trao đổi thông tin hạch toán hoàn thuế, hạch toán thu
ngân sách nhà nước bằng phương thức điện tử thì thực hiện theo quy định về giao
dịch điện tử của Tổng cục Thuế và Kho bạc Nhà nước.
Điều 20. Công
khai thông tin giải quyết hoàn thuế
1. Người nộp thuế thực hiện
hoàn thuế điện tử được tra cứu thông tin về việc giải quyết hoàn thuế của cơ
quan thuế theo quy định tại Thông tư số 110/2013/TT-BTC .
2. Cơ quan
thuế công khai trên Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế về:
- Thời Điểm tiếp nhận hồ sơ hoàn
thuế; thời Điểm tiếp nhận văn bản giải trình, bổ sung thông tin, tài liệu của
người nộp thuế.
- Thời Điểm ban hành thông báo, quyết
định giải quyết hoàn thuế giá trị gia tăng của cơ quan thuế.
Điều 21. Kiểm tra, thanh
tra sau hoàn thuế đối với người nộp thuế
1. Cơ quan thuế lập kế hoạch kiểm tra, thanh tra
sau hoàn thuế và thực hiện kiểm tra, thanh tra sau hoàn thuế theo quy định của Khoản 18 Điều 1 Luật Quản lý thuế số 21/2012/QH13.
2. Cơ quan thuế căn cứ kết quả đánh giá rủi ro
quy định tại Điều 6 Thông tư này, lựa chọn hồ sơ thuộc diện
hoàn thuế trước, kiểm tra sau có dấu hiệu rủi ro cao để bổ sung kế hoạch kiểm
tra, thanh tra sau hoàn thuế trong năm và thực hiện kiểm tra, thanh tra sau
hoàn thuế đảm bảo theo đúng thời hạn được quy định tại Khoản
18 Điều 1 Luật quản lý thuế số 21/2012/QH13.
3. Căn cứ kết quả kiểm
tra, thanh tra sau hoàn thuế tại trụ sở người nộp thuế, trường hợp phát hiện số
thuế đã hoàn chưa đúng quy định, cơ quan thuế ban hành Quyết định để thu hồi số
tiền thuế đã hoàn cho người nộp thuế, xử phạt vi phạm, tính tiền chậm nộp theo
quy định.
Chương III
QUẢN LÝ KINH PHÍ
HOÀN THUẾ GIÁ TRỊ GIA TĂNG
Điều 22. Lập
dự toán kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng
1. Dự toán
kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng được lập theo quy định của Luật Thuế giá trị
gia tăng, Luật Quản lý thuế, Luật Ngân sách nhà nước.
Quy trình,
mẫu biểu lập dự toán kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng được thực hiện theo
quy định về lập dự toán ngân sách nhà nước.
2. Cục Thuế có trách nhiệm lập dự
toán kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng thuộc phạm vi quản lý hoàn thuế trên địa
bàn tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương. Căn cứ dự toán kinh phí hoàn thuế giá
trị gia tăng của các Cục Thuế, Tổng cục Thuế lập dự toán kinh phí hoàn thuế giá
trị gia tăng trên phạm vi toàn quốc.
3. Trong quá trình thực hiện hoàn
thuế giá trị gia tăng cho người nộp thuế, nếu phát sinh số thuế giá trị gia
tăng phải hoàn vượt nguồn kinh phí đã bố trí trong dự toán đã được cấp có thẩm
quyền phê duyệt. Tổng cục Thuế báo cáo Bộ trưởng Bộ Tài
chính theo quy định của Luật Ngân sách Nhà nước.
Điều 23. Quản
lý, Điều hành nguồn kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng
1. Tổng cục
Thuế quản lý, Điều hành nguồn kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng, định kỳ
tháng, quý (chậm nhất ngày 10 tháng tiếp theo liền kề), tổng hợp số tiền đã chi
hoàn thuế giá trị gia tăng, số tiền thu hồi hoàn thuế giá trị gia tăng trên phạm
vi toàn quốc và xác định dự toán kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng còn được sử
dụng.
2. Tổng
cục Thuế tổ chức công tác thông tin, báo cáo định kỳ về việc quản lý sử dụng
kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng trên cơ sở hệ thống thông tin quản lý thuế
thống nhất toàn quốc. Hàng tháng, quý thực hiện dự báo số
thuế giá trị gia tăng phải hoàn trên phạm vi toàn quốc để theo dõi, Điều hành
công tác hoàn thuế giá trị gia tăng.
3. Dự toán kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng hàng năm được quản lý, sử dụng theo quy định
của Luật Ngân sách Nhà nước.
Điều 24. Hạch
toán kế toán hoàn thuế giá trị gia tăng tại Kho bạc Nhà nước
1. Kho bạc Nhà nước cấp tỉnh thực
hiện hạch toán, kế toán hoàn thuế giá trị gia tăng theo quy định về kế toán
ngân sách nhà nước hiện hành.
Định kỳ tháng, năm Kho bạc Nhà nước
cấp tỉnh đối chiếu, xác nhận báo cáo kế toán hoàn thuế giá trị gia tăng với cơ
quan thuế đồng cấp theo quy định.
2. Định kỳ tháng, năm, ngay sau
khi khoá sổ kế toán, Kho bạc Nhà nước cung cấp số liệu về tình hình thực hiện
chi hoàn thuế giá trị gia tăng tại từng tỉnh, thành phố và trong phạm vi toàn
quốc cho Tổng cục Thuế để theo dõi, đối chiếu và quản lý dự toán hoàn thuế giá
trị gia tăng.
Điều 25. Hạch toán thu hồi hoàn thuế giá trị gia tăng
1. Số tiền thu hồi hoàn thuế giá
trị gia tăng nộp trong năm ngân sách nào thì được hạch toán giảm chi hoàn thuế
giá trị gia tăng của năm ngân sách đó.
2. Cuối ngày làm việc hoặc chậm nhất
ngày làm việc tiếp theo, Kho bạc Nhà nước cấp tỉnh gửi Bảng kê chứng từ thu hồi
hoàn thuế đã hạch toán (trường hợp trao đổi thông tin điện tử) hoặc chứng từ
thu hồi hoàn thuế đã hạch toán (trường hợp trao đổi thông tin bằng giấy) cho cơ
quan thuế đồng cấp để thực hiện hạch toán kế toán thuế nội địa. Kho bạc Nhà nước
đối chiếu, xác nhận báo cáo kế toán thu hồi hoàn thuế cho cơ quan thuế đồng cấp
theo quy định.
3. Định kỳ hàng tháng, năm, ngay
sau khi khoá sổ kế toán, Kho bạc Nhà nước cung cấp số liệu về tình hình thực hiện
thu hồi hoàn thuế giá trị gia tăng tại từng tỉnh, thành phố và trong phạm vi
toàn quốc cho Tổng cục Thuế để theo dõi, đối chiếu và quản lý dự toán hoàn thuế
giá trị gia tăng.
Điều 26. Quyết toán nguồn kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng
1. Tổng cục Thuế có trách nhiệm
quyết toán nguồn kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng theo dự toán đã được Quốc
hội thông qua.
2. Tổng cục
trưởng Tổng cục Thuế có trách nhiệm tổ chức công tác kế toán hoàn thuế giá trị
gia tăng tại cơ quan thuế các cấp theo quy định, hướng dẫn Cục Thuế thực hiện
quyết toán chi hoàn thuế giá trị gia tăng.
3. Kết
thúc năm ngân sách và sau thời gian chỉnh lý ngân sách, Tổng cục Thuế thực hiện
quyết toán việc sử dụng nguồn kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng, có xác nhận
của Kho bạc Nhà nước và Vụ Ngân sách Nhà nước để tổng hợp quyết toán ngân sách
nhà nước theo quy định.
Chương IV
TRÁCH NHIỆM CỦA CÁC CƠ QUAN QUẢN LÝ NHÀ NƯỚC
TRONG VIỆC QUẢN LÝ HOÀN THUẾ GIÁ TRỊ GIA TĂNG
Điều 27.
Trách nhiệm của cơ quan thuế
1. Quản lý, thực hiện hoàn thuế
giá trị gia tăng đúng quy định của Luật Thuế giá trị gia tăng, Luật Quản lý thuế,
Luật ngân sách nhà nước, các văn bản hướng dẫn thi hành Luật và hướng dẫn tại
Thông tư này.
2. Chủ trì
trao đổi thông tin và phối hợp công tác với các cơ quan có liên quan trong việc
thực hiện các biện pháp nghiệp vụ quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng.
3. Xây dựng cơ sở dữ liệu và ứng dụng
công nghệ thông tin để thực hiện hoàn thuế điện tử, áp dụng quản lý rủi ro
trong hoàn thuế giá trị gia tăng, giám sát hoàn thuế giá trị gia tăng, hỗ trợ
người nộp thuế tra cứu thông tin về giải quyết hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng
của cơ quan thuế trên Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế.
4. Lập dự toán kinh phí hoàn thuế
giá trị gia tăng, quản lý dự toán và chi hoàn thuế giá trị gia tăng trong phạm
vi dự toán hoàn thuế giá trị gia tăng đã được phê duyệt, thực hiện quyết toán chi hoàn thuế giá trị gia tăng, thu hồi
hoàn thuế giá trị gia tăng đảm bảo an toàn, chặt chẽ tiền của ngân sách nhà nước
và theo đúng quy định của pháp luật.
Điều 28.
Trách nhiệm của cơ quan hải quan
1. Thực hiện kiểm tra, giám sát hải
quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu của người nộp thuế theo pháp luật hải
quan
2. Thực hiện trao đổi thông tin và
phối hợp công tác theo Quy chế trao đổi thông tin và phối hợp công tác giữa cơ
quan hải quan và cơ quan thuế.
Điều 29.
Trách nhiệm của Vụ Ngân sách Nhà nước
1. Chủ trì, phối hợp với Tổng cục
Thuế trong việc lập dự toán kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng, tổng hợp dự
toán kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng, quyết toán kinh phí hoàn thuế giá trị
gia tăng theo quy định của Luật Ngân sách nhà nước.
2. Phối hợp với Tổng cục Thuế Điều
hành dự toán kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng được Quốc hội phê duyệt. Trường
hợp dự toán kinh phí không đủ chi hoàn thuế giá trị gia tăng cho người nộp thuế
theo quy định của Luật thuế giá trị gia tăng và Luật Quản lý thuế, chủ trì
trình cơ quan có thẩm quyền theo quy định của Luật Ngân sách nhà nước.
Điều 30.
Trách nhiệm của Kho bạc Nhà nước
1. Theo dõi, kiểm soát chứng từ
chi hoàn thuế giá trị gia tăng, thu hồi hoàn thuế giá trị gia tăng theo quy định
tại Thông tư này.
2. Hạch toán đầy đủ, chính xác, kịp
thời chi hoàn thuế giá trị gia tăng, thu hồi hoàn thuế giá trị gia tăng theo
đúng quy định.
3. Phối hợp với
cơ quan thuế thực hiện hoàn thuế cho người nộp thuế trong phạm vi dự toán kinh
phí hoàn thuế giá trị gia tăng đã được phê duyệt.
4. Cung cấp chính xác, kịp thời, đầy
đủ cho cơ quan thuế số liệu về chi hoàn thuế, thu hồi hoàn thuế giá trị gia
tăng của người nộp thuế, tổng hợp thực chi hoàn thuế giá trị gia tăng, thu hồi
hoàn thuế giá trị gia tăng theo quy định; định kỳ hàng tháng, quý, năm đối chiếu,
xác nhận với cơ quan thuế theo quy định về kế toán ngân sách nhà nước.
5. Thực hiện quyết toán kinh phí
hoàn thuế giá trị gia tăng theo quy định của Luật Ngân sách nhà nước.
Chương V
TỔ CHỨC THỰC HIỆN
Điều 31. Hiệu
lực thi hành
1. Thông tư này có hiệu lực thi
hành kể từ ngày 13 tháng 8 năm 2016.
2. Kể từ khi Thông tư này có hiệu
lực thi hành, các văn bản sau đây hết hiệu lực thi hành:
- Thông tư số
94/2010/TT-BTC ngày 30/6/2010 của Bộ
Tài chính hướng dẫn thực hiện hoàn thuế GTGT đối với hàng hoá xuất khẩu;
- Quyết định
số 2404/QĐ-BTC ngày 27/9/2012 của Bộ trưởng Bộ Tài chính về việc ban hành Chế độ
kiểm tra hoàn thuế GTGT thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau;
- Thông tư số 150/2013/TT-BTC ngày
29/10/2013 của Bộ Tài chính hướng dẫn về lập, quản lý và thực hiện hoàn thuế từ
Quỹ hoàn thuế giá trị gia tăng.
3. Quy định chuyển tiếp
a) Các hồ sơ đề nghị hoàn thuế thuộc
phạm vi Điều chỉnh của Thông tư này đã nộp cơ quan thuế trước thời Điểm Thông
tư này có hiệu lực thi hành, đáp ứng Điều kiện, trường hợp hoàn thuế theo quy định
của pháp luật về thuế giá trị gia tăng và Luật Quản lý thuế và cơ quan thuế
đang giải quyết hoàn thuế theo quy định của Luật Quản lý thuế (cơ quan thuế
chưa ban hành quyết định hoàn thuế) được áp dụng quy định về giải quyết hoàn
thuế trước thời Điểm có hiệu lực thi hành tại Thông tư này.
b) Thu hồi toàn bộ số dư tài Khoản
dự toán kinh phí hoàn thuế giá trị gia tăng đã phân bổ cho Cục Thuế sử dụng (cấp
4) tại thời Điểm Thông tư này có hiệu lực thi hành về tài Khoản dự toán hoàn
thuế giá trị gia tăng của Tổng cục Thuế (cấp 1) để quản lý dự toán tập trung tại
Tổng cục Thuế. Kho bạc Nhà nước hướng dẫn chi hoàn thuế, hạch toán hoàn thuế,
thu hồi hoàn thuế giá trị gia tăng theo quy định tại Thông tư này.
4. Các nội
dung khác không hướng dẫn tại Thông tư này được thực hiện theo quy định của
pháp luật về thuế hiện hành.
5. Quá trình thực hiện, nếu
các văn bản liên quan dẫn chiếu tại Thông
tư này được sửa đổi, bổ sung hoặc thay thế thì thực hiện theo văn bản mới
được sửa đổi, bổ sung hoặc thay thế.
Điều 32.
Trách nhiệm thi hành
1. Tổng cục
trưởng Tổng cục Thuế ban hành quy trình hoàn thuế áp dụng thống nhất trong
ngành Thuế đúng quy định tại Luật Quản lý thuế, Luật Thuế giá trị gia tăng, Luật
Giao dịch điện tử, các văn bản hướng dẫn thi hành và hướng dẫn tại Thông tư
này; chỉ đạo, hướng dẫn triển khai và kiểm tra thực hiện tại cơ quan thuế các cấp.
2. Tổng cục Thuế thực hiện việc
xây dựng cơ sở dữ liệu về hoàn thuế giá trị gia tăng, quy chế phối hợp công tác
và trao đổi thông tin với các cơ quan có liên quan và ứng dụng công nghệ thông
tin trong kết nối thông tin với các cơ quan, tổ chức, cá nhân có liên quan để
quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng theo quy định tại Thông tư này.
3. Thủ trưởng cơ quan thuế, cơ
quan hải quan, Kho bạc nhà nước, Vụ Ngân sách nhà nước và các tổ chức, cá nhân
có liên quan có trách nhiệm hướng dẫn và tổ chức thực hiện theo nội dung Thông
tư này.
Trong quá trình thực hiện nếu có
vướng mắc, đề nghị các tổ chức, cá nhân phản ánh kịp thời về Bộ Tài chính để
nghiên cứu giải quyết./.
Nơi nhận:
- Văn phòng Trung ương
và các Ban của Đảng;
- Văn phòng Quốc hội;
- Văn phòng Chủ tịch nước;
- Văn phòng Tổng Bí thư;
- Viện Kiểm sát nhân dân tối cao;
- Toà án nhân dân tối cao;
- Kiểm toán nhà nước;
- Các Bộ, cơ quan ngang Bộ,
cơ quan thuộc Chính phủ,
- Cơ quan Trung ương của các đoàn thể;
- Uỷ ban nhân dân, Sở Tài chính, Cục Thuế, Kho bạc nhà nước các tỉnh, thành
phố trực thuộc Trung ương;
- Công báo Chính phủ;
- Cục Kiểm tra văn bản (Bộ Tư pháp);
- Website Chính phủ;
- Website Bộ Tài chính; Website Tổng cục Thuế;
- Các đơn vị thuộc Bộ Tài chính;
- Lưu: VT, TCT.
|
KT. BỘ TRƯỞNG
THỨ TRƯỞNG
Đỗ Hoàng Anh Tuấn
|