Trung tâm Xây dựng hạ tầng khu công nghiệp (KCN) Thốt Nốt là đơn vị sự nghiệp công lập tự cân đối thu chi, hoạt động trong lĩnh vực kinh doanh cơ sở hạ tầng KCN Thốt Nốt và cung cấp các dịch vụ có liên quan theo quy định của pháp luật. Quá trình thành lập Trung tâm như sau: Năm 2002, đơn vị là Ban Quản lý dự án Trung tâm công nghiệp - Tiểu thủ công nghiệp huyện Thốt Nốt; Năm 2006 chuyển thành Trung tâm Xây dựng hạ tầng Cụm công nghiệp - Tiểu thủ công nghiệp Thốt Nốt; Năm 2009, đổi tên thành Trung tâm Xây dựng hạ tầng KCN Thốt Nốt. Quá trình đầu tư chia làm các giai đoạn: Giai đoạn 1, 2: Được ngân sách hỗ trợ không hoàn lại 30%; phần còn lại huy động từ tiền thuê lại đất của doanh nghiệp để đầu tư (chủ yếu từ giai đoạn 2002-2006); Giai đoạn 3: Không sử dụng vốn ngân sách, nguồn thu, chi theo quy định của ngành chức năng, Trung tâm có các nguồn thu và sử dụng chi như sau: - Nguồn thu từ tiền cho thuê lại đất chi cho việc đầu tư cơ sở hạ tầng KCN Thốt Nốt và trả tiền thuê đất hàng năm đối với Nhà nước, trả nợ vay, lãi vay để đầu tư cơ sở hạ tầng KCN. - Nguồn thu từ phí sử dụng cơ sở hạ tầng hàng năm dùng cho việc duy tu, sửa chữa cơ sở hạ tầng và chi phí cho hoạt động của đơn vị. - Thu từ việc cung cấp các hoạt động dịch vụ (chủ yếu là xử lý nước thải) chi cho các khoản chi phí có liên quan đến hoạt động dịch vụ này (có kê khai thuế theo quy định). Trung tâm Xây dựng hạ tầng KCN Thốt Nốt hỏi, hoạt động thu của đơn vị từ nguồn tiền thuê lại đất và phí sử dụng cơ sở hạ tầng có phải là nguồn thu sự nghiệp của đơn vị hay không? Đối với nguồn thu từ tiền thuê lại đất tại dự án giai đoạn 3 đầu tư từ nguồn vốn không phải ngân sách Nhà nước thì xem là hoạt động kinh doanh hạ tầng hay vẫn là nguồn thu sự nghiệp? Ngoài ra, việc thu tiền thuê lại đất có phải xuất hóa đơn cho doanh nghiệp không vì đơn vị là đơn vị sự nghiệp công lập? Các khoản chi phí đã đầu tư giai đoạn 2002-2006 (Ban quản lý dự án Trung tâm công nghiệp - Tiểu thủ công nghiệp) có được đưa vào chi phí để khấu trừ thuế thu nhập doanh nghiệp không? Thực hiện theo trình tự như thế nào?