THUẾ - KẾ TOÁN

Cơ quan giải quyết hoàn thuế GTGT 2025 theo Thông tư 94/2025/TT-BTC

Chuyên viên pháp lý Kiều Diễm

14:18 15/10/25

Cơ quan giải quyết hoàn thuế GTGT 2025 là cơ quan thuế quản lý trực tiếp trừ trường hợp hoàn thuế GTGT của dự án đầu tư thì thuế tỉnh nơi người nộp thuế khai thuế giải quyết.

>> Cách hoàn thuế GTGT đối với ngân hàng thương mại là đại lý hoàn thuế GTGT cho khách xuất cảnh từ 03/9/2025

>> So sánh thực hiện chế độ kế toán giữa hộ kinh doanh và doanh nghiệp nhỏ

1. Cơ quan giải quyết hoàn thuế GTGT 2025 theo Thông tư 94/2025/TT-BTC

Ngày 14/10/2025, Bộ Tài chính ban hành Thông tư 94/2025/TT-BTC sửa đổi, bổ sung một số điều của Thông tư 80/2021/TT-BTC và sửa đổi, bổ sung một số biểu mẫu của Thông tư 40/2021/TT-BTC. Thông tư 94/2025/TT-BTC có hiệu lực từ ngày 14/10/2025.

Thông tư 94/2025/TT-BTC

Theo đó, Cơ quan giải quyết hoàn thuế GTGT 2025 được hướng dẫn cụ thể tại Thông tư 94/2025/TT-BTC.

Căn cứ khoản 1 Điều 1 Thông tư 94/2025/TT-BTC, trách nhiệm giải quyết hồ sơ hoàn thuế cụ thể như sau:

(i) Cơ quan thuế quản lý trực tiếp có trách nhiệm tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế trừ trường hợp tại khoản (ii) dưới đây.

(ii) Thuế tỉnh, thành phố nơi người nộp thuế khai thuế giá trị gia tăng của dự án đầu tư theo quy định tại điểm a khoản 1 Điều 11 Nghị định 126/2020/NĐ-CP có trách nhiệm tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế đối với dự án đầu tư của người nộp thuế.

(iii) Cơ quan thuế quản lý trực tiếp có trách nhiệm tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng đầu vào chưa được khấu trừ hết của cơ sở kinh doanh khi giải thể, phá sản.

Như vậy, cơ quan giải quyết hoàn thuế GTGT 2025 là cơ quan thuế quản lý trực tiếp trừ trường hợp hoàn thuế GTGT của dự án đầu tư thì thuế tỉnh, thành phố nơi người nộp thuế khai thuế giải quyết.

Cơ quan giải quyết hoàn thuế GTGT 2025 theo Thông tư 94/2025/TT-BTC (Ảnh minh họa – Nguồn Internet)

2. 08 trường hợp hoàn thuế GTGT 2025

Căn cứ Mục 3 Chương III Nghị định 181/2025/NĐ-CP, các trường hợp được hoàn thuế GTGT bao gồm:

- Hoàn thuế đối với xuất khẩu

- Hoàn thuế đối với đầu tư

- Hoàn thuế đối với hàng hóa, dịch vụ chịu thuế suất thuế giá trị gia tăng 5%

- Hoàn thuế đối với cơ sở kinh doanh khi giải thể, phá sản

- Hoàn thuế đối với hàng hóa mua tại Việt Nam mang theo khi xuất cảnh

- Hoàn thuế đối với các chương trình, dự án sử dụng vốn ODA không hoàn lại hoặc viện trợ không hoàn lại, viện trợ nhân đạo

- Hoàn thuế đối với hàng hóa, dịch vụ mua tại Việt Nam của đối tượng được hưởng quyền ưu đãi miễn trừ ngoại giao

- Hoàn thuế theo điều ước quốc tế

>> Xem chi tiết tại công việc pháp lý: Thủ tục hoàn thuế giá trị gia tăng từ 01/7/2025

>> Xem thêm: Điều kiện hoàn thuế giá trị gia tăng từ 01/7/2025

3. Điểm mới về hoàn thuế GTGT hàng xuất khẩu từ 1/7/2025

Trước đây, Luật thuế GTGT vẫn cho phép hoàn thuế GTGT với xuất khẩu trong trường hợp hàng hoá nhập khẩu sau đó xuất khẩu sang nước khác; chỉ không cho phép hoàn thuế trường hợp này nếu không thực hiện việc xuất khẩu tại địa bàn hoạt động hải quan theo quy định của Luật hải quan. Nếu công ty nhập khẩu hàng sau đó xuất khẩu sang nước khác và việc xuất khẩu được thực hiện tại địa bàn hoạt động hải quan theo quy định của Luật hải quan thì vẫn thuộc đối tượng được hoàn thuế GTGT với xuất khẩu.

Tuy nhiên, từ ngày 01/7/2025, doanh nghiệp thực hiện nhập khẩu hàng hóa, sau đó xuất khẩu hàng hóa đó sang nước khác thì không thuộc đối tượng được hoàn thuế GTGT với xuất khẩu, kể cả việc xuất khẩu được thực hiện tại địa bàn hoạt động hải quan.

>> Xen chi tiết tại bài viết: Hoàn thuế GTGT hàng xuất khẩu từ 1/7/2025 có gì khác?

4. Một số sai sót thường gặp về thủ tục hoàn thuế GTGT 2025

(i) Một số sai sót trong quá trình hậu kiểm

- Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa dịch vụ không phục vụ sản xuất, kinh doanh.

- Kê khai khấu trừ thuế GTGT đầu vào của các hóa đơn sai sót không đúng kỳ tính thuế.

- Khai bổ sung hồ sơ khai thuế sau khi cơ quan thuế đã ban hành kết luận, quyết định xử lý về thuế.

- Kê khai thuế GTGT của hàng hóa dịch vụ phục vụ sản xuất kinh doanh (mẫu 01/GTGT) sang hàng hóa dịch vụ phục vụ cho dự án đầu tư (mẫu 02/GTGT) và ngược lại .

- Sử dụng hóa đơn không hợp pháp và sử dụng không hợp pháp hóa đơn.

- Không có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với hàng hóa dịch vụ mua vào để khấu trừ thuế đúng quy định.

- Hàng hóa dịch vụ xuất khẩu không có chứng từ thanh toán qua Ngân hàng để đáp ứng điều kiện khấu trừ, hoàn thuế.

(ii) Về thủ tục hoàn thuế

- Hồ sơ không đúng và đủ theo quy định tại Thông tư 80/2021/TT-BTC.

- Kê khai bổ sung hồ sơ khai thuế không đúng quy định.

- Phân bổ số thuế được hoàn không đúng theo quy định đối với hàng hóa dịch vụ xuất khẩu.

- Đề nghị hoàn thuế quá 10% doanh thu xuất khẩu.

>> Xem thêm:

Không được hoàn thuế GTGT khi chuyển đổi, sáp nhập, hợp nhất, chia, tách doanh nghiệp từ 01/7/2025

Trường hợp nào được hoàn thuế GTGT đối với cơ sở kinh doanh sản xuất hàng hóa chỉ áp dụng thuế suất 5%?

- Nội dung nêu trên là phần giải đáp, tư vấn của chúng tôi dành cho khách hàng của Pháp luật doanh nghiệp. Nếu quý khách còn vướng mắc, vui lòng gửi về Email [email protected].

- Nội dung bài viết mang tính chất tham khảo;

- Điều khoản được áp dụng có thể đã hết hiệu lực tại thời điểm bạn đang đọc.