Hướng dẫn kê khai thuế GTGT với dự án đang xin giấy phép theo Công văn 3867 QNI QLDN2 năm 2026 chi tiết?
Về việc kê khai thuế GTGT trong giai đoạn đang xin giấy phép cho dự án đầu tư, Thuế tỉnh Quảng Ninh có Tải về Công văn 3867/QNI-QLDN2 năm 2026 chi tiết như sau:
Tại khoản 5 Điều 19 Thông tư 89/2026/TT-BTC quy định:
Điều 19. Khai thuế giá trị gia tăng
…
5. Hồ sơ khai thuế
… b.7) Người nộp thuế đang hoạt động có dự án đầu tư thuộc trường hợp hoàn thuế và có nhu cầu hoàn thuế giá trị gia tăng thì phải lập hồ sơ khai thuế giá trị gia tăng riêng cho từng dự án đầu tư; đồng thời phải bù trừ số thuế giá trị gia tăng của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho từng dự án đầu tư với số thuế giá trị gia tăng phải nộp (nếu có) của hoạt động, kinh doanh đang thực hiện cùng kỳ tính thuế của người nộp thuế, Ban quản lý dự án, chi nhánh, tổ chức kinh tế mới được giao khai thuế giá trị gia tăng của dự án đầu tư. Số thuế giá trị gia tăng của dự án đầu tư được bù trừ tối đa bằng số thuế giá trị gia tăng phải nộp trên tờ khai thuế mẫu số 01/GTGT. Trường hợp dự án đầu tư đang trong giai đoạn đầu tư có phát sinh doanh thu chạy thử, doanh thu hoạt động tài chính, doanh thu thanh lý nguyên vật liệu thì kê khai doanh thu phát sinh này vào tờ khai thuế mẫu số 01/GTGT và phải bù trừ số thuế giá trị gia tăng đầu vào của dự án đầu tư trên tờ khai thuế mẫu số 02/GTGT với số thuế phát sinh trên tờ khai thuе mẫu số 01/GTGT.
Tại khoản 1 Điều 30 Nghị định 181/2025/NĐ-CP quy định:
Điều 30. Hoàn thuế đối với đầu tư
1...Trường hợp cơ sở kinh doanh là chủ dự án đầu tư thành lập tổ chức kinh tế mới hoặc giao cho Ban Quản lý dự án, chi nhánh trực tiếp thực hiện, quản lý dự án đầu tư thì tổ chức kinh tế mới thành lập, Ban Quản lý dự án, chi nhánh được khẩu trừ và hoàn thuế giá trị gia tăng đối với dự án đầu tư. Tổ chức kinh tế mới thành lập, Ban Quản lý dự án, chi nhánh phải bù trừ số thuế giá trị gia tăng của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho dự án đầu tư với số thuế giá trị gia tăng phải nộp của hoạt động sản xuất, kinh doanh đang thực hiện của cơ sở kinh doanh, tổ chức kinh tể, chi nhánh cùng kỳ tính thuế (nếu có). Sau khi bù trừ nếu số thuế giá trị gia tăng đầu vào của dự án đầu tư chưa được khẩu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế giá trị gia tăng theo quy định tại Điều này…
Tại mẫu số 01/GTGT tờ khai thuế GTGT quy định tại Phụ lục 1 ban hành kèm theo Thông tư 89/2026/TT-BTC áp dụng đối với người nộp thuế tính thuế theo phương pháp khấu trừ có hoạt động sản xuất kinh doanh.
Tại mẫu số 02/GTGT tờ khai thuế GTGT quy định tại Phụ lục 1 ban hành kèm theo Thông tư 89/2026/TT-BTC áp dụng đối với người nộp thuế tính thuế theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư thuộc trường hợp được hoàn thuế và có nhu cầu hoàn thuế.
Tại khoản 1 Điều 17 Thông tư 89/2026/TT-BTC quy định:
Điều 17. Quy định chung về khai, tính, phân bổ thuế, khoản thu khác
1. Người nộp thuế khai hồ sơ khai thuế, khoản thu khác (sau đây gọi chung là hồ sơ khai thuế) theo từng loại thuế, khoản thu khác, phù hợp với phương pháp tính thuế, khoản thu khác và kỳ tính thuế, khoản thu khác.
Tại khoản 1,3, 9 Điều 11 Nghị định 252/2026/NĐ-CP quy định:
Điều 11. Các trường hợp không phải nộp hồ sơ khai thuế, khoản thu khác
1. Người nộp thuế chỉ có hoạt động, kinh doanh thuộc đối tượng không chịu thuế theo quy định của pháp luật về thuế,...
…
3. Doanh nghiệp chế xuất chỉ có hoạt động chế xuất thì không phải nộp hồ sơ khai thuế giá trị gia tăng.
…
9. Người nộp thuế thuộc diện được hoàn thuế theo quy định của pháp luật về thuế giá trị gia tăng không phải nộp hồ sơ khai thuế giá trị gia tăng trong các trường hợp sau:
a) Chủ chương trình, dự án hoặc nhà thầu chính (bao gồm cả văn phòng điều hành của nhà thầu chính tại Việt Nam), tổ chức do phía nhà tài trợ nước ngoài chỉ định việc quản lý chương trình, dự án sử dụng vốn Hỗ trợ Phát triển Chính thức (ODA) không hoàn lại (bao gồm cả văn phòng điều hành của nhà tài trợ hoặc tổ chức quản lý, thực hiện chương trình, dự án do nhà tài trợ chỉ định);
b) Tổ chực ở Việt Nam sử dụng tiền viện trợ không hoàn lại, tiền viện trợ nhân đạo của tổ chức, cá nhân nước ngoài để mua hàng hóa, địch vụ phục vụ cho chương trình, dự án viện trợ không hoàn lại, viện trợ nhân đạo tại Việt Nam;
c) Tổ chức, cá nhân được hưởng quyền ưu đãi miễn trừ ngoại giao theo quy định của pháp luật về ngoại giao mua hàng hóa, dịch vụ tại Việt Nam.
Căn cứ các quy định nêu trên, trường hợp Công ty tính thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ, có dự án đầu tư thuộc diện được hoàn thuế GTGT, không thuộc các trường hợp không phải nộp hồ sơ khai thuế GTGT theo quy định tại khoản 1, 3, 9 Điều 11 Nghị định 252/2026/NĐ-CP thì Công ty phải nộp các hồ sơ khai thuế GTGT mẫu 01/GTGT Tải về, mẫu 02/GTGT Tải về theo quy định tại khoản 1 Điều 17, khoản 5 Điều 19 Thông tư 89/2026/TT-BTC, khoản 1 Điều 30 Nghị định 181/2025/NĐ-CP.

Hướng dẫn kê khai thuế GTGT với dự án đang xin giấy phép theo Công văn 3867 QNI QLDN2 năm 2026 chi tiết? (hình từ internet)
Dự án đầu tư được hoàn thuế GTGT nhưng không tiếp tục thực hiện có phải trả lại số tiền thuế đã hoàn không?
Theo Điều 30 Nghị định 181/2025/NĐ-CP, dự án đầu tư được hoàn thuế GTGT nhưng không tiếp tục thực hiện sẽ phải trả lại số tiền thuế đã hoàn nếu chưa phát sinh thuế GTGT đầu ra của hoạt động sản xuất, kinh doanh chính theo dự án đầu tư. Cụ thể:
- Cơ sở kinh doanh đã đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ thuế, có dự án đầu tư đang trong giai đoạn đầu tư có phát sinh thuế GTGT đầu vào mà chưa được hoàn thuế thì được bù trừ với số thuế GTGT phải nộp (nếu có). Sau khi bù trừ nếu số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế GTGT.
- Trong trường hợp dự án đầu tư chưa đi vào hoạt động sản xuất, kinh doanh nhưng phải chấm dứt hoạt động, chưa phát sinh thuế GTGT đầu ra của hoạt động sản xuất, kinh doanh chính theo dự án đầu tư thì cơ sở kinh doanh phải nộp lại số thuế GTGT đã được hoàn vào ngân sách nhà nước theo quy định.
Bài viết này có hữu ích không?
- - Nội dung nêu trên là phần giải đáp, tư vấn của chúng tôi dành cho khách hàng của THƯ VIỆN PHÁP LUẬT. Nếu quý khách còn vướng mắc, vui lòng gửi về Email [email protected];
- - Nội dung bài viết chỉ mang tính chất tham khảo;
- - Điều khoản được áp dụng có thể đã hết hiệu lực tại thời điểm bạn đang đọc;
- - Mọi ý kiến thắc mắc về bản quyền của bài viết vui lòng liên hệ qua địa chỉ mail [email protected];