Công ty đã lập hóa đơn theo từng hạng mục công trình nhưng giảm giá trị công trình sau quyết toán thì xử lý thế nào?

Công ty đã lập hóa đơn theo từng hạng mục công trình nhưng giảm giá trị công trình sau quyết toán thì xử lý thế nào?

Theo điểm b khoản 3 Điều 47 Luật quản lý thuế 2019 quy định:

Khai bổ sung hồ sơ khai thuế

...

3. Sau khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền đã ban hành kết luận, quyết định xử lý về thuế sau thanh tra, kiểm tra tại trụ sở của người nộp thuế thì việc khai bổ sung hồ sơ khai thuế được quy định như sau:

...

b) Trường hợp người nộp thuế phát hiện hồ sơ khai thuế có sai, sót nếu khai bổ sung làm giảm số tiền thuế phải nộp hoặc làm tăng số tiền thuế được khấu trừ, tăng số tiền thuế được miễn, giảm, hoàn thì thực hiện theo quy định về giải quyết khiếu nại về thuế.

...

Đồng thời, điểm b khoản 2 điều 19 Nghị định 123/2020/NĐ-CP quy định về xử lý hoá đơn có sai sót thì hóa đơn theo từng hạng mục công trình nhưng giảm giá trị công trình sau quyết toán sẽ xử lý như sau:

Xử lý hóa đơn có sai sót

...

2. Trường hợp hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế hoặc hóa đơn điện tử không có mã của cơ quan thuế đã gửi cho người mua mà người mua hoặc người bán phát hiện có sai sót thì xử lý như sau:

...

b) Trường hợp có sai: mã số thuế; sai sót về số tiền ghi trên hóa đơn, sai về thuế suất, tiền thuế hoặc hàng hóa ghi trên hóa đơn không đúng quy cách, chất lượng thì có thể lựa chọn một trong hai cách sử dụng hóa đơn điện tử như sau:

b1) Người bán lập hóa đơn điện tử điều chỉnh hóa đơn đã lập có sai sót. Trường hợp người bán và người mua có thỏa thuận về việc lập văn bản thỏa thuận trước khi lập hóa đơn điều chỉnh cho hóa đơn đã lập có sai sót thì người bán và người mua lập văn bản thỏa thuận ghi rõ sai sót, sau đó người bán lập hóa đơn điện tử điều chỉnh hóa đơn đã lập có sai sót.

Hóa đơn điện tử điều chỉnh hóa đơn điện tử đã lập có sai sót phải có dòng chữ “Điều chỉnh cho hóa đơn Mẫu số... ký hiệu... số... ngày... tháng... năm”.

b2) Người bán lập hóa đơn điện tử mới thay thế cho hóa đơn điện tử có sai sót trừ trường hợp người bán và người mua có thỏa thuận về việc lập văn bản thỏa thuận trước khi lập hóa đơn thay thế cho hóa đơn đã lập có sai sót thì người bán và người mua lập văn bản thỏa thuận ghi rõ sai sót, sau đó người bán lập hóa đơn điện tử thay thế hóa đơn đã lập có sai sót.

Hóa đơn điện tử mới thay thế hóa đơn điện tử đã lập có sai sót phải có dòng chữ “Thay thế cho hóa đơn Mẫu số... ký hiệu... số... ngày... tháng... năm”.

Người bán ký số trên hóa đơn điện tử mới điều chỉnh hoặc thay thế cho hóa đơn điện tử đã lập có sai sót sau đó người bán gửi cho người mua (đối với trường hợp sử dụng hóa đơn điện tử không có mã của cơ quan thuế) hoặc gửi cơ quan thuế để cơ quan thuế cấp mã cho hóa đơn điện tử mới để gửi cho người mua (đối với trường hợp sử dụng hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế).

...

Đồng thời, khoản 6 Điều 12 Thông tư 78/2021/TT-BTC hướng dẫn xử lý chuyển tiếp đối với hóa đơn phát hành theo Nghị định 51/2010/NĐ-CP như sau:

Xử lý chuyển tiếp

...

6. Kể từ thời điểm doanh nghiệp, tổ chức, hộ, cá nhân kinh doanh sử dụng hóa đơn điện tử theo quy định tại Nghị định số 123/2020/NĐ-CP và quy định tại Thông tư này, nếu phát hiện hóa đơn đã lập theo quy định tại Nghị định số 51/2010/NĐ-CP ngày 14/5/2010, Nghị định số 04/2014/NĐ-CP ngày 17/01/2014 của Chính phủ và các văn bản hướng dẫn của Bộ Tài chính mà hóa đơn này có sai sót thì người bán và người mua phải lập văn bản thỏa thuận ghi rõ sai sót, người bán thực hiện thông báo với cơ quan thuế theo Mẫu số 04/SS-HĐĐT ban hành kèm theo Nghị định số 123/2020/NĐ-CP và lập hóa đơn hóa đơn điện tử mới (hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế hoặc hóa đơn điện tử không có mã) thay thế cho hóa đơn đã lập có sai sót. Hóa đơn điện tử thay thế hóa đơn đã lập có sai sót phải có dòng chữ “Thay thế cho hóa đơn Mẫu số... ký hiệu... số... ngày... tháng... năm”. Người bán ký số trên hóa đơn điện tử mới thay thế hóa đơn đã lập có sai sót (hóa đơn lập theo Nghị định số 51/2010/NĐ-CP, Nghị định số 04/2014/NĐ-CP của Chính phủ và các văn bản hướng dẫn của Bộ Tài chính) để gửi cho người mua (đối với trường hợp sử dụng hóa đơn điện tử không có mã) hoặc người bán gửi cơ quan thuế để được cấp mã cho hóa đơn điện tử thay thế hóa đơn đã lập (đối với trường hợp sử dụng hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế).

Ngoài ra, tại Công văn 7452/CT-TTHT năm 2024 Tải về của Cục Thuế tỉnh Lào Cai hướng dẫn về lập hóa đơn, kê khai thuế đối với công trình điều chỉnh giảm sau Quyết toán như sau:

Trường hợp Công ty đã lập hóa đơn theo từng hạng mục công trình hoàn thành bàn giao nhưng khi duyệt quyết toán có điều chỉnh giảm giá trị công trình thì Công ty lập hóa đơn điều chỉnh theo nguyên tắc sau:

+ Đối với các hóa đơn đã lập theo quy định tại Nghị định số 51/2010/NĐ-CP ngày 14/05/2010 của Chính phủ thì người bán và người mua phải lập văn bản thỏa thuận ghi rõ sai sót, người bán thực hiện thông báo với Cơ quan Thuế theo mẫu số 04/SS-HĐĐT ban hành kèm theo Nghị định số 123/2020/NĐ-CP và lập hóa đơn mới thay thế theo hướng dẫn tại khoản 6 Điều 12 Thông tư số 78/2021/TT-BTC;

+ Đối với các hóa đơn đã lập theo quy định tại Nghị định số 123/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020 của Chính phủ thì Công ty lập hóa đơn điều chỉnh giảm giá trị công trình theo hướng dẫn tại điểm b khoản 2 điều 19 Nghị định số 123/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020 của Chính phủ.

- Về việc kê khai điều chỉnh giảm doanh thu Công ty thực hiện theo hướng dẫn tại điểm b khoản 3 Điều 47 Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14.

Như vậy, đối với công ty đã lập hóa đơn theo từng hạng mục công trình nhưng giảm giá trị công trình sau quyết toán thì sẽ phải lập hoá đơn điều chỉnh, trong đó:

- Hoá đơn lập theo Nghị định 51/2010/NĐ-CP thì người bán và người mua phải lập văn bản thỏa thuận ghi rõ sai sót, người bán thông báo với Cơ quan Thuế theo mẫu số 04/SS-HĐĐT và lập hóa đơn mới thay thế.

- Nếu hoá đơn lập theo Nghị định 123/2020/NĐ-CP thì Công ty lập hóa đơn điều chỉnh giảm giá trị công trình theo điểm b khoản 2 điều 19 Nghị định 123/2020/NĐ-CP.

Tuy nhiên, từ năm 2026, quy định trên đã đổi khác

Quy định tại điểm b khoản 3 Điều 47 Luật quản lý thuế 2019 đã bị bãi bỏ bởi điểm b khoản 6 Điều 6 Luật sửa đổi Luật Chứng khoán, Luật Kế toán, Luật Kiểm toán độc lập, Luật Ngân sách Nhà nước, Luật Quản lý, sử dụng tài sản công, Luật Quản lý thuế, Luật Thuế thu nhập cá nhân, Luật Dự trữ quốc gia, Luật Xử lý vi phạm hành chính 2024 từ ngày 01/01/2025.

Ngày 20/3/2025, Chính phủ ban hành Nghị định 70/2025/NĐ-CP sửa đổi, bổ sung một số điều của Nghị định 123/2020/NĐ-CP về hóa đơn, chứng từ.

Cụ thể, Điều 19 Nghị định 123/2020/NĐ-CP đã được sửa đổi bởi khoản 13 Điều 1 Nghị định 70/2025/NĐ-CP có hiệu lực từ ngày 01/06/2025 như sau:

Thay thế, điều chỉnh hóa đơn điện tử

...

4. Hóa đơn để điều chỉnh hóa đơn điện tử đã lập trong một số trường hợp như sau:

a) Đối với các hóa đơn điện tử đã lập khi bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ không bị sai nhưng khi thanh toán thực tế hoặc khi quyết toán có sự thay đổi về giá trị, khối lượng trên cơ sở kết luận của cơ quan nhà nước có thẩm quyền theo quy định của pháp luật có liên quan thì người bán thực hiện lập hóa đơn điện tử mới đối với số chênh lệch qua quyết toán phản ánh theo đúng nghiệp vụ kinh tế phát sinh (phát sinh giảm ghi âm (-) hoặc phát sinh tăng ghi dương (+) phù hợp với thực tế).

...

Công ty đã lập hóa đơn theo từng hạng mục công trình nhưng giảm giá trị công trình sau quyết toán thì người bán thực hiện lập hóa đơn điện tử mới đối với số chênh lệch qua quyết toán phản ánh theo đúng nghiệp vụ kinh tế phát sinh: phát sinh giảm ghi âm (-) phù hợp với thực tế.

Về kê khai thuế, theo điểm đ khoản 5 Điều 19 Nghị định 123/2020/NĐ-CP đã được sửa đổi bởi khoản 13 Điều 1 Nghị định 70/2025/NĐ-CP, đối với hóa đơn lập theo khoản 4, bên bán kê khai tại kỳ phát sinh hóa đơn điều chỉnh, bên mua kê khai tại kỳ nhận được hóa đơn, không thực hiện khai bổ sung đối với kỳ của hóa đơn gốc.

Công ty đã lập hóa đơn theo từng hạng mục công trình nhưng giảm giá trị công trình sau quyết toán thì xử lý thế nào? (Hình từ Internet)

Thời điểm lập hóa đơn giá trị gia tăng đối với công trình xây dựng là khi nào?

Theo khoản 4 Điều 9 Nghị định 123/2020/NĐ-CP quy định thời điểm lập hóa đơn đối với công trình xây dựng như sau:

Thời điểm lập hóa đơn

...

4. Thời điểm lập hóa đơn đối với một số trường hợp cụ thể như sau:

...

c) Đối với hoạt động xây dựng, lắp đặt, thời điểm lập hóa đơn là thời điểm nghiệm thu, bàn giao công trình, hạng mục công trình, khối lượng xây dựng, lắp đặt hoàn thành, không phân biệt đã thu được tiền hay chưa thu được tiền.

Như vậy, thời điểm lập hóa đơn giá trị gia tăng đối với công trình xây dựng là thời điểm nghiệm thu.

Như phân tích ở Mục 1, Nghị định 70/2025/NĐ-CP sửa đổi, bổ sung một số điều của Nghị định 123/2020/NĐ-CP về hóa đơn, chứng từ, cụ thể:

Căn cứ khoản 4 Điều 9 Nghị định 123/2020/NĐ-CP được sửa đổi bởi điểm b khoản 6 Điều 1 Nghị định 70/2025/NĐ-CP quy định thời điểm lập hóa đơn như sau:

Thời điểm lập hóa đơn

...

4. Thời điểm lập hóa đơn đối với một số trường hợp cụ thể như sau:

...

b) Đối với dịch vụ viễn thông (bao gồm cả dịch vụ viễn thông giá trị gia tăng), dịch vụ công nghệ thông tin (bao gồm dịch vụ trung gian thanh toán sử dụng trên nền tảng viễn thông, công nghệ thông tin) phải thực hiện đối soát dữ liệu kết nối giữa các cơ sở kinh doanh dịch vụ, thời điểm lập hóa đơn là thời điểm hoàn thành việc đối soát dữ liệu về cước dịch vụ theo hợp đồng kinh tế giữa các cơ sở kinh doanh dịch vụ nhưng chậm nhất không quá 2 tháng kể từ tháng phát sinh cước dịch vụ kết nối.

Trường hợp cung cấp dịch vụ viễn thông (bao gồm cả dịch vụ viễn thông giá trị gia tăng) thông qua bán thẻ trả trước, thu cước phí hòa mạng khi khách hàng đăng ký sử dụng dịch vụ mà khách hàng không yêu cầu xuất hóa đơn GTGT hoặc không cung cấp tên, địa chỉ, mã số thuế thì cuối mỗi ngày hoặc định kỳ trong tháng, cơ sở kinh doanh dịch vụ lập chung một hóa đơn GTGT ghi nhận tổng doanh thu phát sinh theo từng dịch vụ người mua không lấy hóa đơn hoặc không cung cấp tên, địa chỉ, mã số thuế.

c) Đối với hoạt động xây dựng, lắp đặt, thời điểm lập hóa đơn là thời điểm nghiệm thu, bàn giao công trình, hạng mục công trình, khối lượng xây dựng, lắp đặt hoàn thành, không phân biệt đã thu được tiền hay chưa thu được tiền.

...

Như vậy, theo quy định trên, từ năm 2026 thời điểm xuất hóa đơn đối với hoạt động xây dựng, lắp đặt được xác định tại thời điểm nghiệm thu, bàn giao công trình, không phân biệt đã thu được tiền hay chưa.