Vì vậy, ngày 27/12/2011, Chính phủ đã ban hành Nghị định 122/2011/NĐ-CP sửa đổi, bổ sung một số điều của Nghị định 124/2008/NĐ-CP
Trong đó nổi bật lên quy định về việc tính thuế TNDN khi chuyển nhượng vốn bằng chứng khoán, chứng chỉ quỹ. Nghị định 124/2008/NĐ-CP không quy định rõ khoản thu nhập từ hoạt động chuyển nhượng vốn không nhận bằng tiền mà nhận bằng tài sản, lợi ích vật chất khác (cổ phiếu, chứng chỉ quỹ) thì có phải đóng thuế TNDN hay không, Nghị định 122/2011/NĐ-CP đã làm rõ vấn đề này, bằng việc quy định có phát sinh thu nhập (kể cả thu nhập bằng tài sản hoặc cổ phiếu, chứng chỉ quỹ) thì phải chịu thuế TNDN.
Trường hợp Công ty Cổ phần chia, tách, hợp nhất, sáp nhập mà hoán đổi cổ phiếu tại thời điểm chia, tách, hợp nhất, sáp nhập nếu phát sinh thu nhập thì phần thu nhập này phải chịu thuế TNDN. Riêng trường hợp phát hành cổ phiếu thì phần chênh lệch giữa giá phát hành và mệnh giá không tính thuế TNDN.
Nghị đinh này có hiệu lực ngày 01/03/2012, hi vọng sẽ gỡ rối được một số vướng mắc của Nghị định 124/2008/NĐ-CP trong thời gian vừa qua.