Về thủ tục chuyển đổi DNTN sang Công ty TNHH các bạn thực hiện theo hướng dẫn tại bài viết
https://khoinghiep.thuvienphapluat.vn/chuyen-doi-thanh-cong-ty-tnhh-trong-doanh-nghiep-tu-nhan/576.html

(tại bài viết đã có hướng dẫn về hồ sơ, biểu mẫu thực hiện thủ tục này). 

Về các chi nhánh: Sau khi chuyển đổi sang Công ty TNHH, các bạn thực hiện đăng ký thay đổi thông tin của chi nhánh để được cấp lại giấy chứng nhận đăng ký chi nhánh theo thông tin của công ty. Thủ tục thực hiện theo hướng dẫn tại bài viết: https://khoinghiep.thuvienphapluat.vn/dang-ky-thay-doi-noi-dung-dang-ky-hoat-dong-cua-chi-nhanh-trong-cong-ty-tnhh/321.html

Về giấy chứng nhận đủ điều kiện an toàn thực phẩm

Theo Khoản 3 Điều 5 Nghị định 155/2018/NĐ-CP(sửa đổi bổ sung cho Khoản 4 Điều 6 Nghị định 67/2016/NĐ-CP) thì trường hợp thay đổi tên của doanh nghiệp hoặc đổi chủ cơ sở, thay đổi địa chỉ nhưng không thay đổi vị trí và quy trình sản xuất thực phẩm, kinh doanh dịch vụ ăn uống và Giấy chứng nhận phải còn thời hạn thì cơ sở gửi thông báo thay đổi thông tin trên Giấy chứng nhận và kèm bản sao văn bản hợp pháp thể hiện sự thay đổi đó đến cơ quan tiếp nhận hồ sơ đã cấp Giấy chứng nhận qua hệ thống dịch vụ công trực tuyến hoặc qua đường bưu điện hoặc tại cơ quan tiếp nhận hồ sơ.

=> Theo đó, nếu chỉ đổi loại hình, tên doanh nghiệp nhưng không thay đổi vị trí và quy trình sản xuất thực phẩm, kinh doanh dịch vụ ăn uống và Giấy chứng nhận còn thời hạn thì các bạn thông báo thay đổi thông tin trên Giấy chứng nhận và kèm bản sao văn bản hợp pháp thể hiện sự thay đổi đến cơ quan đã cấp giấy chứng nhận ATTP trước đó cho mình.  Văn bản thông bào này do đơn vị tự soạn, hiện không có văn bản quy định mẫu.