Theo quy định tại điểm b.1 khoản 1 điều 25 Thông tư 111/2013/TT-BTC Hướng dẫn Luật thuế thu nhập cá nhân và Nghị định 65/2013/NĐ-CP do Bộ trưởng Bộ Tài chính ban hành:
"Đối với cá nhân cư trú ký hợp đồng lao động từ ba (03) tháng trở lên thì tổ chức, cá nhân trả thu nhập thực hiện khấu trừ thuế theo Biểu thuế lũy tiến từng phần, kể cả trường hợp cá nhân ký hợp đồng từ ba (03) tháng trở lên tại nhiều nơi."
Căn cứ quy định trên, công ty chị cũng thực hiện khấu trừ thuế cho sếp chị theo biểu thuế lũy tiến từng phần, xếp chị đã giảm trừ gia cảnh ở công ty A nên công ty chị không tính giảm trừ gia cảnh nữa.
Ví dụ: ở công ty A, xếp chị đóng BHXH, BHYT, BHTN hết 2.000.000 đồng/tháng thì thu nhập tính thuế là 25 tr - (9tr giảm trừ bản thân - 7,2tr cho 2 người phụ thuộc - 2tr tiền BHXH, BHYT, BHTN) = 6,8 triệu.
Áp vào biểu thuế lũy tiến từng phần ban hành theo điều 7 Thông tư 111/2013/TT-BTC thì số thuế TNCN sếp chị nộp hàng tháng ở công ty A là 430.000 đồng.
Lấy thu nhập tính thuế ở công ty A là 6,8 triệu + 15tr ở công ty chị = 21,8 triệu áp vào biểu thuế lũy tiến ban hành theo điều 7 hoặc Phụ lục: 01/PL-TNCN Thông tư 111/2013/TT-BTC thì ra số thuế phải nộp ở cả 2 nơi là: (20% x 21,8) - 1,65tr = 2.710.000 đồng. Trừ đi 430.000 đồng tiền thuế ở công ty A thì ra số thuế phải khấu trừ ở công ty B.
Năm 2017, NLĐ có thu nhập ở 2 nơi nên sau này quyết toán thuế năm 2017 thì NLĐ tự quyết toán chứ không được ủy quyền cho công ty quyết toán.